Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB9

Sf3b1, Splicing factor 3B subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b1Q99NB9 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sf3b1Q99NB9 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sf3b1Q99NB9 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Sf3b1Q99NB9 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sf3b1Q99NB9 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Sf3b1Q99NB9 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Sf3b1Q99NB9 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Sf3b1Q99NB9 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sf3b1Q99NB9 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sf3b1Q99NB9 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sf3b1Q99NB9 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sf3b1Q99NB9 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sf3b1Q99NB9 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sf3b1Q99NB9 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sf3b1Q99NB9 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sf3b1Q99NB9 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sf3b1Q99NB9 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sf3b1Q99NB9 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sf3b1Q99NB9 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sf3b1Q99NB9 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sf3b1Q99NB9 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sf3b1Q99NB9 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sf3b1Q99NB9 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sf3b1Q99NB9 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sf3b1Q99NB9 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sf3b1Q99NB9 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sf3b1Q99NB9 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sf3b1Q99NB9 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sf3b1Q99NB9 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sf3b1Q99NB9 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sf3b1Q99NB9 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sf3b1Q99NB9 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sf3b1Q99NB9 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sf3b1Q99NB9 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sf3b1Q99NB9 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sf3b1Q99NB9 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sf3b1Q99NB9 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Sf3b1Q99NB9 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sf3b1Q99NB9 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sf3b1Q99NB9 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sf3b1Q99NB9 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Sf3b1Q99NB9 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Sf3b1Q99NB9 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sf3b1Q99NB9 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sf3b1Q99NB9 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sf3b1Q99NB9 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sf3b1Q99NB9 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sf3b1Q99NB9 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Sf3b1Q99NB9 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sf3b1Q99NB9 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sf3b1Q99NB9 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sf3b1Q99NB9 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Sf3b1Q99NB9 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sf3b1Q99NB9 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sf3b1Q99NB9 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sf3b1Q99NB9 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sf3b1Q99NB9 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sf3b1Q99NB9 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sf3b1Q99NB9 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Sf3b1Q99NB9 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sf3b1Q99NB9 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sf3b1Q99NB9 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sf3b1Q99NB9 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sf3b1Q99NB9 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sf3b1Q99NB9 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sf3b1Q99NB9 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sf3b1Q99NB9 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sf3b1Q99NB9 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sf3b1Q99NB9 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sf3b1Q99NB9 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sf3b1Q99NB9 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sf3b1Q99NB9 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sf3b1Q99NB9 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sf3b1Q99NB9 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sf3b1Q99NB9 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sf3b1Q99NB9 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Sf3b1Q99NB9 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Sf3b1Q99NB9 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Sf3b1Q99NB9 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sf3b1Q99NB9 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sf3b1Q99NB9 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sf3b1Q99NB9 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sf3b1Q99NB9 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sf3b1Q99NB9 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sf3b1Q99NB9 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sf3b1Q99NB9 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sf3b1Q99NB9 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Sf3b1Q99NB9 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sf3b1Q99NB9 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sf3b1Q99NB9 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sf3b1Q99NB9 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sf3b1Q99NB9 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sf3b1Q99NB9 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sf3b1Q99NB9 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sf3b1Q99NB9 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sf3b1Q99NB9 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sf3b1Q99NB9 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sf3b1Q99NB9 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sf3b1Q99NB9 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sf3b1Q99NB9 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
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