Protein–RNA interactions for Protein: Q99N92

Mrpl27, 39S ribosomal protein L27, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl27Q99N92 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl27Q99N92 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl27Q99N92 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl27Q99N92 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl27Q99N92 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl27Q99N92 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl27Q99N92 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl27Q99N92 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl27Q99N92 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl27Q99N92 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl27Q99N92 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl27Q99N92 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl27Q99N92 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl27Q99N92 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl27Q99N92 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl27Q99N92 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl27Q99N92 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl27Q99N92 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl27Q99N92 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl27Q99N92 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl27Q99N92 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl27Q99N92 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl27Q99N92 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl27Q99N92 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl27Q99N92 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl27Q99N92 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl27Q99N92 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl27Q99N92 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl27Q99N92 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl27Q99N92 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl27Q99N92 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl27Q99N92 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl27Q99N92 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl27Q99N92 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl27Q99N92 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl27Q99N92 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mrpl27Q99N92 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mrpl27Q99N92 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mrpl27Q99N92 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mrpl27Q99N92 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mrpl27Q99N92 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Mrpl27Q99N92 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mrpl27Q99N92 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Mrpl27Q99N92 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mrpl27Q99N92 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mrpl27Q99N92 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mrpl27Q99N92 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mrpl27Q99N92 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mrpl27Q99N92 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mrpl27Q99N92 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Mrpl27Q99N92 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mrpl27Q99N92 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mrpl27Q99N92 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mrpl27Q99N92 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mrpl27Q99N92 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mrpl27Q99N92 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mrpl27Q99N92 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mrpl27Q99N92 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Mrpl27Q99N92 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mrpl27Q99N92 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Mrpl27Q99N92 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mrpl27Q99N92 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mrpl27Q99N92 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mrpl27Q99N92 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mrpl27Q99N92 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mrpl27Q99N92 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Mrpl27Q99N92 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mrpl27Q99N92 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mrpl27Q99N92 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mrpl27Q99N92 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mrpl27Q99N92 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Mrpl27Q99N92 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mrpl27Q99N92 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mrpl27Q99N92 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mrpl27Q99N92 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mrpl27Q99N92 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Mrpl27Q99N92 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mrpl27Q99N92 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mrpl27Q99N92 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mrpl27Q99N92 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mrpl27Q99N92 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mrpl27Q99N92 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Mrpl27Q99N92 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Mrpl27Q99N92 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Mrpl27Q99N92 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Mrpl27Q99N92 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Mrpl27Q99N92 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Mrpl27Q99N92 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Mrpl27Q99N92 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Mrpl27Q99N92 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Mrpl27Q99N92 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Mrpl27Q99N92 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Mrpl27Q99N92 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Mrpl27Q99N92 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Mrpl27Q99N92 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Mrpl27Q99N92 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Mrpl27Q99N92 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Mrpl27Q99N92 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Mrpl27Q99N92 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Mrpl27Q99N92 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.3 ms