Protein–RNA interactions for Protein: Q99N13

Hdac9, Histone deacetylase 9, mousemouse

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac9Q99N13 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Hdac9Q99N13 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hdac9Q99N13 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Hdac9Q99N13 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Hdac9Q99N13 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hdac9Q99N13 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hdac9Q99N13 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hdac9Q99N13 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hdac9Q99N13 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hdac9Q99N13 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Hdac9Q99N13 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hdac9Q99N13 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Hdac9Q99N13 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hdac9Q99N13 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hdac9Q99N13 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Hdac9Q99N13 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Hdac9Q99N13 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hdac9Q99N13 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hdac9Q99N13 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hdac9Q99N13 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hdac9Q99N13 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hdac9Q99N13 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Hdac9Q99N13 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Hdac9Q99N13 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hdac9Q99N13 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hdac9Q99N13 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Hdac9Q99N13 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hdac9Q99N13 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Hdac9Q99N13 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Hdac9Q99N13 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Hdac9Q99N13 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hdac9Q99N13 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hdac9Q99N13 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hdac9Q99N13 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hdac9Q99N13 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hdac9Q99N13 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hdac9Q99N13 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hdac9Q99N13 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Hdac9Q99N13 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hdac9Q99N13 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hdac9Q99N13 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hdac9Q99N13 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hdac9Q99N13 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Hdac9Q99N13 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
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