Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

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Length 1,454 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
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PtprtQ99M80 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PtprtQ99M80 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PtprtQ99M80 Mrps23-201ENSMUST00000024486 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PtprtQ99M80 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PtprtQ99M80 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PtprtQ99M80 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PtprtQ99M80 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PtprtQ99M80 Ifna9-201ENSMUST00000102807 573 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PtprtQ99M80 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PtprtQ99M80 Gm11244-201ENSMUST00000121243 237 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PtprtQ99M80 Gm15196-201ENSMUST00000121406 482 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PtprtQ99M80 Polr3c-205ENSMUST00000141377 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PtprtQ99M80 Gm20822-201ENSMUST00000165756 687 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PtprtQ99M80 Gm4775-201ENSMUST00000169588 402 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PtprtQ99M80 Gm20828-201ENSMUST00000170889 687 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PtprtQ99M80 Scgb2b7-201ENSMUST00000178258 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PtprtQ99M80 Gm6606-201ENSMUST00000193613 947 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PtprtQ99M80 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PtprtQ99M80 AC124687.5-201ENSMUST00000222734 596 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PtprtQ99M80 Crygf-201ENSMUST00000027082 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PtprtQ99M80 Gm6304-201ENSMUST00000096579 447 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PtprtQ99M80 AU016765-201ENSMUST00000097295 946 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PtprtQ99M80 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PtprtQ99M80 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PtprtQ99M80 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PtprtQ99M80 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PtprtQ99M80 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PtprtQ99M80 Deup1-201ENSMUST00000045513 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PtprtQ99M80 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PtprtQ99M80 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PtprtQ99M80 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PtprtQ99M80 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PtprtQ99M80 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PtprtQ99M80 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PtprtQ99M80 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PtprtQ99M80 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PtprtQ99M80 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PtprtQ99M80 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PtprtQ99M80 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PtprtQ99M80 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PtprtQ99M80 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PtprtQ99M80 AC159810.1-201ENSMUST00000214838 1480 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
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PtprtQ99M80 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
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PtprtQ99M80 Atp5h-201ENSMUST00000043931 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
PtprtQ99M80 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.54
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PtprtQ99M80 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PtprtQ99M80 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
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PtprtQ99M80 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PtprtQ99M80 Cfap61-201ENSMUST00000116398 1561 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
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PtprtQ99M80 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PtprtQ99M80 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
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PtprtQ99M80 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
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PtprtQ99M80 4930578M01Rik-201ENSMUST00000180490 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PtprtQ99M80 1700085C21Rik-201ENSMUST00000187123 1082 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
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PtprtQ99M80 Nutf2-202ENSMUST00000212042 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
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PtprtQ99M80 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PtprtQ99M80 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PtprtQ99M80 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PtprtQ99M80 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
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PtprtQ99M80 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PtprtQ99M80 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PtprtQ99M80 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PtprtQ99M80 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PtprtQ99M80 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PtprtQ99M80 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PtprtQ99M80 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PtprtQ99M80 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PtprtQ99M80 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PtprtQ99M80 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PtprtQ99M80 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PtprtQ99M80 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PtprtQ99M80 Ube2d-ps-201ENSMUST00000121354 441 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PtprtQ99M80 Saxo2-202ENSMUST00000126478 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PtprtQ99M80 Gm15498-201ENSMUST00000126693 723 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PtprtQ99M80 Gm22388-201ENSMUST00000158194 248 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
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