Protein–RNA interactions for Protein: Q99LF4

Rtcb, tRNA-splicing ligase RtcB homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RtcbQ99LF4 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RtcbQ99LF4 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RtcbQ99LF4 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RtcbQ99LF4 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RtcbQ99LF4 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RtcbQ99LF4 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RtcbQ99LF4 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RtcbQ99LF4 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RtcbQ99LF4 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RtcbQ99LF4 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RtcbQ99LF4 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RtcbQ99LF4 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RtcbQ99LF4 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RtcbQ99LF4 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RtcbQ99LF4 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RtcbQ99LF4 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RtcbQ99LF4 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RtcbQ99LF4 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RtcbQ99LF4 Ccdc163-204ENSMUST00000106464 1213 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RtcbQ99LF4 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RtcbQ99LF4 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RtcbQ99LF4 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RtcbQ99LF4 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RtcbQ99LF4 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RtcbQ99LF4 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RtcbQ99LF4 Gm40709-203ENSMUST00000219695 973 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RtcbQ99LF4 AC099645.1-201ENSMUST00000226476 1105 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RtcbQ99LF4 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RtcbQ99LF4 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RtcbQ99LF4 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RtcbQ99LF4 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RtcbQ99LF4 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RtcbQ99LF4 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RtcbQ99LF4 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RtcbQ99LF4 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RtcbQ99LF4 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RtcbQ99LF4 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RtcbQ99LF4 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RtcbQ99LF4 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RtcbQ99LF4 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RtcbQ99LF4 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RtcbQ99LF4 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RtcbQ99LF4 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RtcbQ99LF4 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RtcbQ99LF4 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RtcbQ99LF4 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RtcbQ99LF4 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RtcbQ99LF4 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RtcbQ99LF4 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RtcbQ99LF4 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RtcbQ99LF4 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RtcbQ99LF4 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RtcbQ99LF4 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RtcbQ99LF4 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RtcbQ99LF4 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RtcbQ99LF4 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RtcbQ99LF4 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RtcbQ99LF4 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RtcbQ99LF4 Gm6407-201ENSMUST00000176468 549 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RtcbQ99LF4 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RtcbQ99LF4 D8Ertd738e-201ENSMUST00000019506 616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RtcbQ99LF4 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RtcbQ99LF4 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RtcbQ99LF4 Mrpl30-201ENSMUST00000027256 969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RtcbQ99LF4 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RtcbQ99LF4 Asna1-201ENSMUST00000064314 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RtcbQ99LF4 Krtap19-9b-201ENSMUST00000077715 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RtcbQ99LF4 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RtcbQ99LF4 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RtcbQ99LF4 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RtcbQ99LF4 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RtcbQ99LF4 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RtcbQ99LF4 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RtcbQ99LF4 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RtcbQ99LF4 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RtcbQ99LF4 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RtcbQ99LF4 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RtcbQ99LF4 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RtcbQ99LF4 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RtcbQ99LF4 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RtcbQ99LF4 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RtcbQ99LF4 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RtcbQ99LF4 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RtcbQ99LF4 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RtcbQ99LF4 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RtcbQ99LF4 Olfr22-ps1-201ENSMUST00000115991 1237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RtcbQ99LF4 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RtcbQ99LF4 Olfr269-ps1-201ENSMUST00000120783 302 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RtcbQ99LF4 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RtcbQ99LF4 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RtcbQ99LF4 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RtcbQ99LF4 Gm28324-201ENSMUST00000187913 264 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RtcbQ99LF4 Gm34023-201ENSMUST00000195539 217 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RtcbQ99LF4 Ptbp2-210ENSMUST00000198403 389 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RtcbQ99LF4 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RtcbQ99LF4 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RtcbQ99LF4 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RtcbQ99LF4 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RtcbQ99LF4 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RtcbQ99LF4 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms