Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms