Protein–RNA interactions for Protein: Q925F3

Rnf144a, E3 ubiquitin-protein ligase RNF144A, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf144aQ925F3 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rnf144aQ925F3 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Rnf144aQ925F3 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Rnf144aQ925F3 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
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Rnf144aQ925F3 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rnf144aQ925F3 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
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Rnf144aQ925F3 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rnf144aQ925F3 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rnf144aQ925F3 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
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Rnf144aQ925F3 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Rnf144aQ925F3 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Rnf144aQ925F3 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Rnf144aQ925F3 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Rnf144aQ925F3 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
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Rnf144aQ925F3 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Rnf144aQ925F3 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rnf144aQ925F3 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rnf144aQ925F3 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rnf144aQ925F3 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rnf144aQ925F3 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rnf144aQ925F3 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rnf144aQ925F3 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rnf144aQ925F3 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rnf144aQ925F3 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rnf144aQ925F3 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Rnf144aQ925F3 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rnf144aQ925F3 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Rnf144aQ925F3 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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