Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHC5

Cabp4, Calcium-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp4Q8VHC5 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cabp4Q8VHC5 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cabp4Q8VHC5 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cabp4Q8VHC5 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Cabp4Q8VHC5 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cabp4Q8VHC5 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cabp4Q8VHC5 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cabp4Q8VHC5 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cabp4Q8VHC5 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cabp4Q8VHC5 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cabp4Q8VHC5 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cabp4Q8VHC5 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Cabp4Q8VHC5 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cabp4Q8VHC5 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cabp4Q8VHC5 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cabp4Q8VHC5 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cabp4Q8VHC5 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cabp4Q8VHC5 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cabp4Q8VHC5 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cabp4Q8VHC5 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Cabp4Q8VHC5 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Cabp4Q8VHC5 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Cabp4Q8VHC5 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cabp4Q8VHC5 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Cabp4Q8VHC5 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Cabp4Q8VHC5 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cabp4Q8VHC5 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Cabp4Q8VHC5 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cabp4Q8VHC5 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cabp4Q8VHC5 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cabp4Q8VHC5 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cabp4Q8VHC5 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cabp4Q8VHC5 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cabp4Q8VHC5 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cabp4Q8VHC5 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cabp4Q8VHC5 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cabp4Q8VHC5 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cabp4Q8VHC5 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cabp4Q8VHC5 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cabp4Q8VHC5 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cabp4Q8VHC5 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cabp4Q8VHC5 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cabp4Q8VHC5 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cabp4Q8VHC5 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cabp4Q8VHC5 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cabp4Q8VHC5 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cabp4Q8VHC5 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cabp4Q8VHC5 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cabp4Q8VHC5 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cabp4Q8VHC5 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cabp4Q8VHC5 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cabp4Q8VHC5 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cabp4Q8VHC5 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cabp4Q8VHC5 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cabp4Q8VHC5 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Cabp4Q8VHC5 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Cabp4Q8VHC5 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cabp4Q8VHC5 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cabp4Q8VHC5 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cabp4Q8VHC5 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cabp4Q8VHC5 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cabp4Q8VHC5 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cabp4Q8VHC5 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cabp4Q8VHC5 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cabp4Q8VHC5 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Cabp4Q8VHC5 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cabp4Q8VHC5 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cabp4Q8VHC5 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cabp4Q8VHC5 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cabp4Q8VHC5 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cabp4Q8VHC5 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cabp4Q8VHC5 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cabp4Q8VHC5 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cabp4Q8VHC5 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cabp4Q8VHC5 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cabp4Q8VHC5 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cabp4Q8VHC5 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cabp4Q8VHC5 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cabp4Q8VHC5 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cabp4Q8VHC5 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Cabp4Q8VHC5 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cabp4Q8VHC5 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cabp4Q8VHC5 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cabp4Q8VHC5 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Cabp4Q8VHC5 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Cabp4Q8VHC5 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cabp4Q8VHC5 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cabp4Q8VHC5 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Cabp4Q8VHC5 AC073947.1-201ENSMUST00000216991 649 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Cabp4Q8VHC5 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cabp4Q8VHC5 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cabp4Q8VHC5 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cabp4Q8VHC5 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cabp4Q8VHC5 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Cabp4Q8VHC5 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cabp4Q8VHC5 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cabp4Q8VHC5 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cabp4Q8VHC5 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cabp4Q8VHC5 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cabp4Q8VHC5 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms