Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE18

Smg8, Protein SMG8, mousemouse

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Length 991 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg8Q8VE18 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smg8Q8VE18 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smg8Q8VE18 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smg8Q8VE18 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smg8Q8VE18 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Smg8Q8VE18 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smg8Q8VE18 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smg8Q8VE18 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smg8Q8VE18 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smg8Q8VE18 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smg8Q8VE18 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smg8Q8VE18 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smg8Q8VE18 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smg8Q8VE18 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smg8Q8VE18 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smg8Q8VE18 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smg8Q8VE18 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smg8Q8VE18 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smg8Q8VE18 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smg8Q8VE18 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smg8Q8VE18 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smg8Q8VE18 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smg8Q8VE18 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Smg8Q8VE18 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smg8Q8VE18 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smg8Q8VE18 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smg8Q8VE18 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smg8Q8VE18 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smg8Q8VE18 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smg8Q8VE18 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smg8Q8VE18 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Smg8Q8VE18 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Smg8Q8VE18 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smg8Q8VE18 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smg8Q8VE18 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smg8Q8VE18 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smg8Q8VE18 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Smg8Q8VE18 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Smg8Q8VE18 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smg8Q8VE18 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smg8Q8VE18 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smg8Q8VE18 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smg8Q8VE18 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smg8Q8VE18 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smg8Q8VE18 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smg8Q8VE18 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smg8Q8VE18 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smg8Q8VE18 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smg8Q8VE18 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smg8Q8VE18 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smg8Q8VE18 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smg8Q8VE18 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smg8Q8VE18 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smg8Q8VE18 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smg8Q8VE18 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smg8Q8VE18 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smg8Q8VE18 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smg8Q8VE18 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smg8Q8VE18 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Smg8Q8VE18 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smg8Q8VE18 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smg8Q8VE18 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Smg8Q8VE18 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smg8Q8VE18 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Smg8Q8VE18 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smg8Q8VE18 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Smg8Q8VE18 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Smg8Q8VE18 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smg8Q8VE18 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Smg8Q8VE18 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Smg8Q8VE18 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smg8Q8VE18 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smg8Q8VE18 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smg8Q8VE18 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smg8Q8VE18 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smg8Q8VE18 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smg8Q8VE18 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smg8Q8VE18 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smg8Q8VE18 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smg8Q8VE18 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smg8Q8VE18 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smg8Q8VE18 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smg8Q8VE18 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smg8Q8VE18 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smg8Q8VE18 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smg8Q8VE18 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smg8Q8VE18 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smg8Q8VE18 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smg8Q8VE18 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smg8Q8VE18 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smg8Q8VE18 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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