Protein–RNA interactions for Protein: Q8VD57

Sft2d2, Vesicle transport protein SFT2B, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d2Q8VD57 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sft2d2Q8VD57 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Sft2d2Q8VD57 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sft2d2Q8VD57 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sft2d2Q8VD57 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sft2d2Q8VD57 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sft2d2Q8VD57 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sft2d2Q8VD57 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sft2d2Q8VD57 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sft2d2Q8VD57 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sft2d2Q8VD57 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Sft2d2Q8VD57 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Sft2d2Q8VD57 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Sft2d2Q8VD57 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sft2d2Q8VD57 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sft2d2Q8VD57 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sft2d2Q8VD57 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Sft2d2Q8VD57 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sft2d2Q8VD57 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sft2d2Q8VD57 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sft2d2Q8VD57 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sft2d2Q8VD57 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Sft2d2Q8VD57 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sft2d2Q8VD57 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Sft2d2Q8VD57 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sft2d2Q8VD57 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sft2d2Q8VD57 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sft2d2Q8VD57 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sft2d2Q8VD57 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sft2d2Q8VD57 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sft2d2Q8VD57 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sft2d2Q8VD57 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sft2d2Q8VD57 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sft2d2Q8VD57 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sft2d2Q8VD57 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sft2d2Q8VD57 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sft2d2Q8VD57 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sft2d2Q8VD57 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Sft2d2Q8VD57 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sft2d2Q8VD57 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sft2d2Q8VD57 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sft2d2Q8VD57 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sft2d2Q8VD57 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sft2d2Q8VD57 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sft2d2Q8VD57 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sft2d2Q8VD57 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sft2d2Q8VD57 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sft2d2Q8VD57 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sft2d2Q8VD57 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms