Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 506 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ubxn4Q8VCH8 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ubxn4Q8VCH8 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ubxn4Q8VCH8 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ubxn4Q8VCH8 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Ubxn4Q8VCH8 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Ubxn4Q8VCH8 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ubxn4Q8VCH8 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ubxn4Q8VCH8 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ubxn4Q8VCH8 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ubxn4Q8VCH8 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ubxn4Q8VCH8 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ubxn4Q8VCH8 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ubxn4Q8VCH8 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ubxn4Q8VCH8 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ubxn4Q8VCH8 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Ubxn4Q8VCH8 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ubxn4Q8VCH8 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ubxn4Q8VCH8 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ubxn4Q8VCH8 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ubxn4Q8VCH8 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ubxn4Q8VCH8 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ubxn4Q8VCH8 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ubxn4Q8VCH8 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ubxn4Q8VCH8 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ubxn4Q8VCH8 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ubxn4Q8VCH8 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ubxn4Q8VCH8 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ubxn4Q8VCH8 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ubxn4Q8VCH8 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ubxn4Q8VCH8 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ubxn4Q8VCH8 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ubxn4Q8VCH8 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ubxn4Q8VCH8 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Ubxn4Q8VCH8 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ubxn4Q8VCH8 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ubxn4Q8VCH8 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Ubxn4Q8VCH8 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ubxn4Q8VCH8 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Ubxn4Q8VCH8 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Ubxn4Q8VCH8 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ubxn4Q8VCH8 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ubxn4Q8VCH8 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ubxn4Q8VCH8 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ubxn4Q8VCH8 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ubxn4Q8VCH8 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ubxn4Q8VCH8 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ubxn4Q8VCH8 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ubxn4Q8VCH8 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Ubxn4Q8VCH8 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ubxn4Q8VCH8 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ubxn4Q8VCH8 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ubxn4Q8VCH8 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ubxn4Q8VCH8 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ubxn4Q8VCH8 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ubxn4Q8VCH8 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ubxn4Q8VCH8 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ubxn4Q8VCH8 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ubxn4Q8VCH8 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ubxn4Q8VCH8 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Ubxn4Q8VCH8 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Ubxn4Q8VCH8 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ubxn4Q8VCH8 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ubxn4Q8VCH8 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ubxn4Q8VCH8 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ubxn4Q8VCH8 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ubxn4Q8VCH8 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ubxn4Q8VCH8 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ubxn4Q8VCH8 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ubxn4Q8VCH8 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ubxn4Q8VCH8 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ubxn4Q8VCH8 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Ubxn4Q8VCH8 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ubxn4Q8VCH8 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Ubxn4Q8VCH8 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ubxn4Q8VCH8 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ubxn4Q8VCH8 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ubxn4Q8VCH8 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ubxn4Q8VCH8 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ubxn4Q8VCH8 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ubxn4Q8VCH8 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ubxn4Q8VCH8 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ubxn4Q8VCH8 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ubxn4Q8VCH8 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ubxn4Q8VCH8 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ubxn4Q8VCH8 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ubxn4Q8VCH8 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ubxn4Q8VCH8 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Ubxn4Q8VCH8 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ubxn4Q8VCH8 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ubxn4Q8VCH8 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ubxn4Q8VCH8 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ubxn4Q8VCH8 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ubxn4Q8VCH8 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ubxn4Q8VCH8 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ubxn4Q8VCH8 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ubxn4Q8VCH8 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ubxn4Q8VCH8 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ubxn4Q8VCH8 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ubxn4Q8VCH8 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
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