Protein–RNA interactions for Protein: Q8R332

Nup58, Nucleoporin p58/p45, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup58Q8R332 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nup58Q8R332 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nup58Q8R332 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nup58Q8R332 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Nup58Q8R332 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Nup58Q8R332 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nup58Q8R332 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nup58Q8R332 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nup58Q8R332 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Nup58Q8R332 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nup58Q8R332 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nup58Q8R332 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nup58Q8R332 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nup58Q8R332 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nup58Q8R332 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nup58Q8R332 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nup58Q8R332 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nup58Q8R332 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nup58Q8R332 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nup58Q8R332 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Nup58Q8R332 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nup58Q8R332 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nup58Q8R332 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nup58Q8R332 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nup58Q8R332 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nup58Q8R332 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nup58Q8R332 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nup58Q8R332 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nup58Q8R332 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nup58Q8R332 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nup58Q8R332 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nup58Q8R332 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nup58Q8R332 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nup58Q8R332 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nup58Q8R332 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nup58Q8R332 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nup58Q8R332 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nup58Q8R332 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nup58Q8R332 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nup58Q8R332 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nup58Q8R332 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nup58Q8R332 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Nup58Q8R332 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nup58Q8R332 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nup58Q8R332 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nup58Q8R332 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nup58Q8R332 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nup58Q8R332 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nup58Q8R332 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nup58Q8R332 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nup58Q8R332 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nup58Q8R332 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nup58Q8R332 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nup58Q8R332 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nup58Q8R332 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nup58Q8R332 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nup58Q8R332 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nup58Q8R332 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nup58Q8R332 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nup58Q8R332 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nup58Q8R332 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nup58Q8R332 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nup58Q8R332 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nup58Q8R332 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nup58Q8R332 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nup58Q8R332 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nup58Q8R332 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Nup58Q8R332 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Nup58Q8R332 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nup58Q8R332 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nup58Q8R332 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nup58Q8R332 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Nup58Q8R332 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nup58Q8R332 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nup58Q8R332 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Nup58Q8R332 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Nup58Q8R332 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Nup58Q8R332 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Nup58Q8R332 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Nup58Q8R332 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Nup58Q8R332 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Nup58Q8R332 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Nup58Q8R332 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Nup58Q8R332 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Nup58Q8R332 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nup58Q8R332 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nup58Q8R332 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nup58Q8R332 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nup58Q8R332 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nup58Q8R332 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nup58Q8R332 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nup58Q8R332 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nup58Q8R332 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nup58Q8R332 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nup58Q8R332 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nup58Q8R332 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nup58Q8R332 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nup58Q8R332 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nup58Q8R332 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nup58Q8R332 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms