Protein–RNA interactions for Protein: Q8K5B8

Hoxc12, Homeobox protein Hox-C12, mousemouse

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Length 280 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc12Q8K5B8 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Cad-211ENSMUST00000202795 6559 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Tmem56-207ENSMUST00000155309 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Slc10a7-202ENSMUST00000209490 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Gm16140-201ENSMUST00000117191 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Zfp609-201ENSMUST00000159109 7777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Sgcz-201ENSMUST00000118896 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Spata2-201ENSMUST00000057627 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 1700016D06Rik-201ENSMUST00000033906 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
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