Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3G5

Vrk3, Inactive serine/threonine-protein kinase VRK3, mousemouse

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vrk3Q8K3G5 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
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Vrk3Q8K3G5 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
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Vrk3Q8K3G5 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
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