Protein–RNA interactions for Protein: Q8K377

Lrrtm1, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 1, mousemouse

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Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm1Q8K377 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Lrrtm1Q8K377 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lrrtm1Q8K377 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lrrtm1Q8K377 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lrrtm1Q8K377 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lrrtm1Q8K377 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lrrtm1Q8K377 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lrrtm1Q8K377 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lrrtm1Q8K377 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lrrtm1Q8K377 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Lrrtm1Q8K377 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Lrrtm1Q8K377 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Lrrtm1Q8K377 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Lrrtm1Q8K377 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Lrrtm1Q8K377 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Lrrtm1Q8K377 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Lrrtm1Q8K377 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Lrrtm1Q8K377 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Lrrtm1Q8K377 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Lrrtm1Q8K377 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Lrrtm1Q8K377 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Lrrtm1Q8K377 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Lrrtm1Q8K377 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Lrrtm1Q8K377 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Lrrtm1Q8K377 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Lrrtm1Q8K377 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Lrrtm1Q8K377 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Lrrtm1Q8K377 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Lrrtm1Q8K377 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Lrrtm1Q8K377 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Lrrtm1Q8K377 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Lrrtm1Q8K377 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Lrrtm1Q8K377 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Lrrtm1Q8K377 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Lrrtm1Q8K377 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Lrrtm1Q8K377 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
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Lrrtm1Q8K377 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Lrrtm1Q8K377 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Lrrtm1Q8K377 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Lrrtm1Q8K377 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Lrrtm1Q8K377 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Lrrtm1Q8K377 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Lrrtm1Q8K377 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Lrrtm1Q8K377 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Lrrtm1Q8K377 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Lrrtm1Q8K377 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Lrrtm1Q8K377 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Lrrtm1Q8K377 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Lrrtm1Q8K377 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
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Lrrtm1Q8K377 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
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Lrrtm1Q8K377 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
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Lrrtm1Q8K377 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
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Lrrtm1Q8K377 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
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Lrrtm1Q8K377 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
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Lrrtm1Q8K377 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
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