Protein–RNA interactions for Protein: Q8K330

Ssh3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, mousemouse

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Length 649 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh3Q8K330 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ssh3Q8K330 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Ssh3Q8K330 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Ssh3Q8K330 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ssh3Q8K330 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ssh3Q8K330 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ssh3Q8K330 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ssh3Q8K330 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ssh3Q8K330 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ssh3Q8K330 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ssh3Q8K330 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ssh3Q8K330 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ssh3Q8K330 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Ssh3Q8K330 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ssh3Q8K330 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ssh3Q8K330 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ssh3Q8K330 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ssh3Q8K330 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ssh3Q8K330 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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Ssh3Q8K330 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ssh3Q8K330 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ssh3Q8K330 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ssh3Q8K330 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ssh3Q8K330 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ssh3Q8K330 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Ssh3Q8K330 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ssh3Q8K330 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ssh3Q8K330 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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Ssh3Q8K330 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Ssh3Q8K330 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
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Ssh3Q8K330 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ssh3Q8K330 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ssh3Q8K330 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ssh3Q8K330 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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Ssh3Q8K330 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ssh3Q8K330 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ssh3Q8K330 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ssh3Q8K330 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ssh3Q8K330 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ssh3Q8K330 Prf1-202ENSMUST00000219375 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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Ssh3Q8K330 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ssh3Q8K330 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ssh3Q8K330 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ssh3Q8K330 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ssh3Q8K330 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ssh3Q8K330 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Ssh3Q8K330 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ssh3Q8K330 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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Ssh3Q8K330 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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Ssh3Q8K330 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ssh3Q8K330 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ssh3Q8K330 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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Ssh3Q8K330 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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Ssh3Q8K330 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Ssh3Q8K330 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ssh3Q8K330 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
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Ssh3Q8K330 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ssh3Q8K330 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ssh3Q8K330 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Ssh3Q8K330 E030026E10Rik-201ENSMUST00000200395 2217 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Ssh3Q8K330 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ssh3Q8K330 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ssh3Q8K330 C2cd5-204ENSMUST00000203187 3494 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ssh3Q8K330 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ssh3Q8K330 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ssh3Q8K330 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ssh3Q8K330 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ssh3Q8K330 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ssh3Q8K330 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ssh3Q8K330 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ssh3Q8K330 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Ssh3Q8K330 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ssh3Q8K330 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ssh3Q8K330 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ssh3Q8K330 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ssh3Q8K330 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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