Protein–RNA interactions for Protein: Q8K045

Pkn3, Serine/threonine-protein kinase N3, mousemouse

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Length 878 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkn3Q8K045 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pkn3Q8K045 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pkn3Q8K045 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pkn3Q8K045 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pkn3Q8K045 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Pkn3Q8K045 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pkn3Q8K045 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pkn3Q8K045 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pkn3Q8K045 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pkn3Q8K045 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pkn3Q8K045 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pkn3Q8K045 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pkn3Q8K045 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pkn3Q8K045 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pkn3Q8K045 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Pkn3Q8K045 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Pkn3Q8K045 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pkn3Q8K045 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pkn3Q8K045 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pkn3Q8K045 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pkn3Q8K045 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pkn3Q8K045 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Pkn3Q8K045 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pkn3Q8K045 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pkn3Q8K045 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pkn3Q8K045 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pkn3Q8K045 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Pkn3Q8K045 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Pkn3Q8K045 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Pkn3Q8K045 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pkn3Q8K045 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pkn3Q8K045 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pkn3Q8K045 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pkn3Q8K045 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Pkn3Q8K045 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Pkn3Q8K045 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Pkn3Q8K045 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Pkn3Q8K045 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Pkn3Q8K045 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Pkn3Q8K045 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pkn3Q8K045 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Pkn3Q8K045 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pkn3Q8K045 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Pkn3Q8K045 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Pkn3Q8K045 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Pkn3Q8K045 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Pkn3Q8K045 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Pkn3Q8K045 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Pkn3Q8K045 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pkn3Q8K045 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pkn3Q8K045 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pkn3Q8K045 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pkn3Q8K045 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pkn3Q8K045 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pkn3Q8K045 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pkn3Q8K045 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Pkn3Q8K045 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pkn3Q8K045 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pkn3Q8K045 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pkn3Q8K045 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Pkn3Q8K045 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC13□□□□□ -0.33
Pkn3Q8K045 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pkn3Q8K045 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pkn3Q8K045 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pkn3Q8K045 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pkn3Q8K045 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pkn3Q8K045 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pkn3Q8K045 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pkn3Q8K045 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pkn3Q8K045 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pkn3Q8K045 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pkn3Q8K045 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pkn3Q8K045 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pkn3Q8K045 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Pkn3Q8K045 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pkn3Q8K045 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pkn3Q8K045 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pkn3Q8K045 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pkn3Q8K045 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pkn3Q8K045 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
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Pkn3Q8K045 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pkn3Q8K045 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pkn3Q8K045 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pkn3Q8K045 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pkn3Q8K045 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pkn3Q8K045 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pkn3Q8K045 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pkn3Q8K045 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Pkn3Q8K045 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pkn3Q8K045 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pkn3Q8K045 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pkn3Q8K045 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pkn3Q8K045 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pkn3Q8K045 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pkn3Q8K045 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pkn3Q8K045 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pkn3Q8K045 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pkn3Q8K045 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pkn3Q8K045 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms