Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGC6

Rbm28, RNA-binding protein 28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm28Q8CGC6 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rbm28Q8CGC6 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rbm28Q8CGC6 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rbm28Q8CGC6 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rbm28Q8CGC6 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rbm28Q8CGC6 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rbm28Q8CGC6 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rbm28Q8CGC6 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rbm28Q8CGC6 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rbm28Q8CGC6 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rbm28Q8CGC6 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rbm28Q8CGC6 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rbm28Q8CGC6 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rbm28Q8CGC6 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rbm28Q8CGC6 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rbm28Q8CGC6 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rbm28Q8CGC6 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rbm28Q8CGC6 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rbm28Q8CGC6 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rbm28Q8CGC6 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rbm28Q8CGC6 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Rbm28Q8CGC6 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rbm28Q8CGC6 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rbm28Q8CGC6 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rbm28Q8CGC6 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rbm28Q8CGC6 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rbm28Q8CGC6 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rbm28Q8CGC6 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rbm28Q8CGC6 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rbm28Q8CGC6 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rbm28Q8CGC6 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rbm28Q8CGC6 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rbm28Q8CGC6 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rbm28Q8CGC6 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rbm28Q8CGC6 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rbm28Q8CGC6 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rbm28Q8CGC6 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rbm28Q8CGC6 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rbm28Q8CGC6 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rbm28Q8CGC6 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rbm28Q8CGC6 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rbm28Q8CGC6 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rbm28Q8CGC6 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rbm28Q8CGC6 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rbm28Q8CGC6 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rbm28Q8CGC6 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rbm28Q8CGC6 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rbm28Q8CGC6 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Rbm28Q8CGC6 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rbm28Q8CGC6 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rbm28Q8CGC6 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rbm28Q8CGC6 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Rbm28Q8CGC6 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rbm28Q8CGC6 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rbm28Q8CGC6 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rbm28Q8CGC6 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rbm28Q8CGC6 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Rbm28Q8CGC6 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Rbm28Q8CGC6 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rbm28Q8CGC6 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rbm28Q8CGC6 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Rbm28Q8CGC6 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Rbm28Q8CGC6 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Rbm28Q8CGC6 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Rbm28Q8CGC6 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rbm28Q8CGC6 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rbm28Q8CGC6 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rbm28Q8CGC6 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rbm28Q8CGC6 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rbm28Q8CGC6 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rbm28Q8CGC6 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rbm28Q8CGC6 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rbm28Q8CGC6 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rbm28Q8CGC6 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Rbm28Q8CGC6 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Rbm28Q8CGC6 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Rbm28Q8CGC6 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Rbm28Q8CGC6 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Rbm28Q8CGC6 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Rbm28Q8CGC6 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rbm28Q8CGC6 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rbm28Q8CGC6 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rbm28Q8CGC6 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rbm28Q8CGC6 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rbm28Q8CGC6 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rbm28Q8CGC6 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rbm28Q8CGC6 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rbm28Q8CGC6 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rbm28Q8CGC6 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rbm28Q8CGC6 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Rbm28Q8CGC6 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Rbm28Q8CGC6 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Rbm28Q8CGC6 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Rbm28Q8CGC6 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Rbm28Q8CGC6 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rbm28Q8CGC6 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rbm28Q8CGC6 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rbm28Q8CGC6 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Rbm28Q8CGC6 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rbm28Q8CGC6 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
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