Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFI2

Cdc34, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 R1, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc34Q8CFI2 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cdc34Q8CFI2 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cdc34Q8CFI2 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cdc34Q8CFI2 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cdc34Q8CFI2 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cdc34Q8CFI2 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cdc34Q8CFI2 Ap3b2-205ENSMUST00000152355 3168 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cdc34Q8CFI2 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cdc34Q8CFI2 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cdc34Q8CFI2 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cdc34Q8CFI2 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cdc34Q8CFI2 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cdc34Q8CFI2 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cdc34Q8CFI2 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cdc34Q8CFI2 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cdc34Q8CFI2 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cdc34Q8CFI2 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cdc34Q8CFI2 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cdc34Q8CFI2 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Cdc34Q8CFI2 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Cdc34Q8CFI2 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Cdc34Q8CFI2 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cdc34Q8CFI2 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cdc34Q8CFI2 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cdc34Q8CFI2 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Cdc34Q8CFI2 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cdc34Q8CFI2 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cdc34Q8CFI2 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cdc34Q8CFI2 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cdc34Q8CFI2 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cdc34Q8CFI2 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cdc34Q8CFI2 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cdc34Q8CFI2 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cdc34Q8CFI2 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Cdc34Q8CFI2 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cdc34Q8CFI2 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cdc34Q8CFI2 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cdc34Q8CFI2 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cdc34Q8CFI2 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cdc34Q8CFI2 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cdc34Q8CFI2 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cdc34Q8CFI2 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cdc34Q8CFI2 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cdc34Q8CFI2 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cdc34Q8CFI2 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cdc34Q8CFI2 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Cdc34Q8CFI2 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cdc34Q8CFI2 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cdc34Q8CFI2 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cdc34Q8CFI2 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cdc34Q8CFI2 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cdc34Q8CFI2 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cdc34Q8CFI2 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cdc34Q8CFI2 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cdc34Q8CFI2 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cdc34Q8CFI2 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cdc34Q8CFI2 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cdc34Q8CFI2 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cdc34Q8CFI2 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cdc34Q8CFI2 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cdc34Q8CFI2 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cdc34Q8CFI2 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cdc34Q8CFI2 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cdc34Q8CFI2 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cdc34Q8CFI2 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cdc34Q8CFI2 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cdc34Q8CFI2 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cdc34Q8CFI2 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cdc34Q8CFI2 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cdc34Q8CFI2 Tro-203ENSMUST00000112709 6610 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cdc34Q8CFI2 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cdc34Q8CFI2 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cdc34Q8CFI2 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cdc34Q8CFI2 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cdc34Q8CFI2 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cdc34Q8CFI2 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cdc34Q8CFI2 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Cdc34Q8CFI2 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cdc34Q8CFI2 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cdc34Q8CFI2 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cdc34Q8CFI2 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cdc34Q8CFI2 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cdc34Q8CFI2 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cdc34Q8CFI2 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cdc34Q8CFI2 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cdc34Q8CFI2 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cdc34Q8CFI2 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cdc34Q8CFI2 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cdc34Q8CFI2 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cdc34Q8CFI2 Gm21986-201ENSMUST00000113671 5560 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cdc34Q8CFI2 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cdc34Q8CFI2 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cdc34Q8CFI2 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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