Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD4

Snx8, Sorting nexin-8, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx8Q8CFD4 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Snx8Q8CFD4 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Snx8Q8CFD4 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Snx8Q8CFD4 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Snx8Q8CFD4 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Snx8Q8CFD4 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Snx8Q8CFD4 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Snx8Q8CFD4 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Snx8Q8CFD4 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Snx8Q8CFD4 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Snx8Q8CFD4 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Snx8Q8CFD4 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Snx8Q8CFD4 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Snx8Q8CFD4 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Snx8Q8CFD4 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Snx8Q8CFD4 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Snx8Q8CFD4 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Snx8Q8CFD4 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Snx8Q8CFD4 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Snx8Q8CFD4 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Snx8Q8CFD4 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Snx8Q8CFD4 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Snx8Q8CFD4 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Snx8Q8CFD4 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Snx8Q8CFD4 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Snx8Q8CFD4 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Snx8Q8CFD4 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Snx8Q8CFD4 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Snx8Q8CFD4 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Snx8Q8CFD4 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Snx8Q8CFD4 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Snx8Q8CFD4 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Snx8Q8CFD4 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Snx8Q8CFD4 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Snx8Q8CFD4 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Snx8Q8CFD4 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Snx8Q8CFD4 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Snx8Q8CFD4 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Snx8Q8CFD4 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Snx8Q8CFD4 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Snx8Q8CFD4 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Snx8Q8CFD4 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Snx8Q8CFD4 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Snx8Q8CFD4 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Snx8Q8CFD4 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Snx8Q8CFD4 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Snx8Q8CFD4 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Snx8Q8CFD4 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Snx8Q8CFD4 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Snx8Q8CFD4 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Snx8Q8CFD4 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Snx8Q8CFD4 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Snx8Q8CFD4 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Snx8Q8CFD4 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Snx8Q8CFD4 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Snx8Q8CFD4 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Snx8Q8CFD4 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Snx8Q8CFD4 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Snx8Q8CFD4 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Snx8Q8CFD4 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Snx8Q8CFD4 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Snx8Q8CFD4 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Snx8Q8CFD4 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Snx8Q8CFD4 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Snx8Q8CFD4 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Snx8Q8CFD4 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Snx8Q8CFD4 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Snx8Q8CFD4 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Snx8Q8CFD4 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Snx8Q8CFD4 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Snx8Q8CFD4 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Snx8Q8CFD4 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Snx8Q8CFD4 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Snx8Q8CFD4 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Snx8Q8CFD4 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Snx8Q8CFD4 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Snx8Q8CFD4 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Snx8Q8CFD4 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Snx8Q8CFD4 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Snx8Q8CFD4 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Snx8Q8CFD4 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Snx8Q8CFD4 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Snx8Q8CFD4 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Snx8Q8CFD4 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Snx8Q8CFD4 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Snx8Q8CFD4 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Snx8Q8CFD4 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Snx8Q8CFD4 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Snx8Q8CFD4 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Snx8Q8CFD4 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Snx8Q8CFD4 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Snx8Q8CFD4 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Snx8Q8CFD4 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Snx8Q8CFD4 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Snx8Q8CFD4 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Snx8Q8CFD4 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Snx8Q8CFD4 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Snx8Q8CFD4 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Snx8Q8CFD4 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Snx8Q8CFD4 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.6 ms