Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEQ0

Cdkl1, Cyclin-dependent kinase-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl1Q8CEQ0 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cdkl1Q8CEQ0 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cdkl1Q8CEQ0 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cdkl1Q8CEQ0 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cdkl1Q8CEQ0 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cdkl1Q8CEQ0 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Cdkl1Q8CEQ0 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cdkl1Q8CEQ0 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Cdkl1Q8CEQ0 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Cdkl1Q8CEQ0 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Cdkl1Q8CEQ0 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cdkl1Q8CEQ0 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cdkl1Q8CEQ0 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cdkl1Q8CEQ0 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Cdkl1Q8CEQ0 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cdkl1Q8CEQ0 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cdkl1Q8CEQ0 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Cdkl1Q8CEQ0 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Cdkl1Q8CEQ0 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cdkl1Q8CEQ0 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cdkl1Q8CEQ0 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cdkl1Q8CEQ0 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cdkl1Q8CEQ0 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Cdkl1Q8CEQ0 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Cdkl1Q8CEQ0 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cdkl1Q8CEQ0 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cdkl1Q8CEQ0 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cdkl1Q8CEQ0 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cdkl1Q8CEQ0 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cdkl1Q8CEQ0 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cdkl1Q8CEQ0 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cdkl1Q8CEQ0 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cdkl1Q8CEQ0 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cdkl1Q8CEQ0 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cdkl1Q8CEQ0 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cdkl1Q8CEQ0 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cdkl1Q8CEQ0 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cdkl1Q8CEQ0 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cdkl1Q8CEQ0 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cdkl1Q8CEQ0 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cdkl1Q8CEQ0 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cdkl1Q8CEQ0 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cdkl1Q8CEQ0 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cdkl1Q8CEQ0 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Cdkl1Q8CEQ0 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cdkl1Q8CEQ0 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cdkl1Q8CEQ0 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cdkl1Q8CEQ0 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cdkl1Q8CEQ0 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cdkl1Q8CEQ0 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cdkl1Q8CEQ0 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cdkl1Q8CEQ0 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cdkl1Q8CEQ0 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cdkl1Q8CEQ0 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cdkl1Q8CEQ0 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cdkl1Q8CEQ0 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cdkl1Q8CEQ0 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cdkl1Q8CEQ0 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cdkl1Q8CEQ0 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cdkl1Q8CEQ0 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Cdkl1Q8CEQ0 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Cdkl1Q8CEQ0 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Cdkl1Q8CEQ0 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cdkl1Q8CEQ0 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Cdkl1Q8CEQ0 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cdkl1Q8CEQ0 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cdkl1Q8CEQ0 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cdkl1Q8CEQ0 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cdkl1Q8CEQ0 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cdkl1Q8CEQ0 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cdkl1Q8CEQ0 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cdkl1Q8CEQ0 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cdkl1Q8CEQ0 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cdkl1Q8CEQ0 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cdkl1Q8CEQ0 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cdkl1Q8CEQ0 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cdkl1Q8CEQ0 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cdkl1Q8CEQ0 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cdkl1Q8CEQ0 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cdkl1Q8CEQ0 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cdkl1Q8CEQ0 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cdkl1Q8CEQ0 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cdkl1Q8CEQ0 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cdkl1Q8CEQ0 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cdkl1Q8CEQ0 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cdkl1Q8CEQ0 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cdkl1Q8CEQ0 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cdkl1Q8CEQ0 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cdkl1Q8CEQ0 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cdkl1Q8CEQ0 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cdkl1Q8CEQ0 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cdkl1Q8CEQ0 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cdkl1Q8CEQ0 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cdkl1Q8CEQ0 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cdkl1Q8CEQ0 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cdkl1Q8CEQ0 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms