Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE24

Pramef8, 4732496O08Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef8Q8CE24 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pramef8Q8CE24 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pramef8Q8CE24 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pramef8Q8CE24 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pramef8Q8CE24 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pramef8Q8CE24 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pramef8Q8CE24 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pramef8Q8CE24 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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Pramef8Q8CE24 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pramef8Q8CE24 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pramef8Q8CE24 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pramef8Q8CE24 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pramef8Q8CE24 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pramef8Q8CE24 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pramef8Q8CE24 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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Pramef8Q8CE24 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
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Pramef8Q8CE24 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pramef8Q8CE24 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pramef8Q8CE24 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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Pramef8Q8CE24 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pramef8Q8CE24 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pramef8Q8CE24 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pramef8Q8CE24 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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Pramef8Q8CE24 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pramef8Q8CE24 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pramef8Q8CE24 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pramef8Q8CE24 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pramef8Q8CE24 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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Pramef8Q8CE24 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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Pramef8Q8CE24 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pramef8Q8CE24 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pramef8Q8CE24 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pramef8Q8CE24 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pramef8Q8CE24 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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Pramef8Q8CE24 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pramef8Q8CE24 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pramef8Q8CE24 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pramef8Q8CE24 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pramef8Q8CE24 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pramef8Q8CE24 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pramef8Q8CE24 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Pramef8Q8CE24 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Pramef8Q8CE24 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pramef8Q8CE24 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pramef8Q8CE24 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pramef8Q8CE24 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pramef8Q8CE24 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pramef8Q8CE24 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pramef8Q8CE24 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pramef8Q8CE24 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pramef8Q8CE24 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pramef8Q8CE24 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pramef8Q8CE24 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pramef8Q8CE24 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pramef8Q8CE24 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pramef8Q8CE24 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pramef8Q8CE24 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pramef8Q8CE24 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pramef8Q8CE24 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pramef8Q8CE24 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pramef8Q8CE24 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Pramef8Q8CE24 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pramef8Q8CE24 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pramef8Q8CE24 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pramef8Q8CE24 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pramef8Q8CE24 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pramef8Q8CE24 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 143.2 ms