Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE13

Ccdc17, Coiled-coil domain-containing protein 17, mousemouse

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Length 565 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc17Q8CE13 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Ccdc17Q8CE13 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc17Q8CE13 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc17Q8CE13 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc17Q8CE13 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc17Q8CE13 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Ccdc17Q8CE13 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc17Q8CE13 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc17Q8CE13 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc17Q8CE13 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc17Q8CE13 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc17Q8CE13 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc17Q8CE13 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Ccdc17Q8CE13 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Ccdc17Q8CE13 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Ccdc17Q8CE13 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Ccdc17Q8CE13 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Ccdc17Q8CE13 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Ccdc17Q8CE13 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc17Q8CE13 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc17Q8CE13 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Ccdc17Q8CE13 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc17Q8CE13 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc17Q8CE13 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc17Q8CE13 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc17Q8CE13 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc17Q8CE13 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc17Q8CE13 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc17Q8CE13 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc17Q8CE13 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc17Q8CE13 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc17Q8CE13 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc17Q8CE13 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc17Q8CE13 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc17Q8CE13 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc17Q8CE13 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc17Q8CE13 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc17Q8CE13 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Ccdc17Q8CE13 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc17Q8CE13 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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