Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCJ3

Ufl1, E3 UFM1-protein ligase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufl1Q8CCJ3 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ufl1Q8CCJ3 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ufl1Q8CCJ3 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ufl1Q8CCJ3 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ufl1Q8CCJ3 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ufl1Q8CCJ3 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ufl1Q8CCJ3 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ufl1Q8CCJ3 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ufl1Q8CCJ3 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Ufl1Q8CCJ3 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ufl1Q8CCJ3 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ufl1Q8CCJ3 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ufl1Q8CCJ3 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ufl1Q8CCJ3 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ufl1Q8CCJ3 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ufl1Q8CCJ3 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ufl1Q8CCJ3 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ufl1Q8CCJ3 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Ufl1Q8CCJ3 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ufl1Q8CCJ3 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ufl1Q8CCJ3 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ufl1Q8CCJ3 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ufl1Q8CCJ3 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ufl1Q8CCJ3 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ufl1Q8CCJ3 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ufl1Q8CCJ3 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ufl1Q8CCJ3 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ufl1Q8CCJ3 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ufl1Q8CCJ3 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ufl1Q8CCJ3 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ufl1Q8CCJ3 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ufl1Q8CCJ3 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ufl1Q8CCJ3 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ufl1Q8CCJ3 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ufl1Q8CCJ3 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ufl1Q8CCJ3 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ufl1Q8CCJ3 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ufl1Q8CCJ3 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ufl1Q8CCJ3 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ufl1Q8CCJ3 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ufl1Q8CCJ3 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ufl1Q8CCJ3 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Ufl1Q8CCJ3 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ufl1Q8CCJ3 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ufl1Q8CCJ3 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ufl1Q8CCJ3 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ufl1Q8CCJ3 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ufl1Q8CCJ3 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ufl1Q8CCJ3 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Ufl1Q8CCJ3 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Ufl1Q8CCJ3 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ufl1Q8CCJ3 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ufl1Q8CCJ3 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ufl1Q8CCJ3 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ufl1Q8CCJ3 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ufl1Q8CCJ3 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ufl1Q8CCJ3 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ufl1Q8CCJ3 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ufl1Q8CCJ3 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ufl1Q8CCJ3 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ufl1Q8CCJ3 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ufl1Q8CCJ3 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ufl1Q8CCJ3 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ufl1Q8CCJ3 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ufl1Q8CCJ3 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Ufl1Q8CCJ3 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ufl1Q8CCJ3 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ufl1Q8CCJ3 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ufl1Q8CCJ3 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ufl1Q8CCJ3 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ufl1Q8CCJ3 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ufl1Q8CCJ3 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ufl1Q8CCJ3 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ufl1Q8CCJ3 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ufl1Q8CCJ3 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ufl1Q8CCJ3 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ufl1Q8CCJ3 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ufl1Q8CCJ3 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ufl1Q8CCJ3 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ufl1Q8CCJ3 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ufl1Q8CCJ3 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ufl1Q8CCJ3 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ufl1Q8CCJ3 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ufl1Q8CCJ3 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ufl1Q8CCJ3 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ufl1Q8CCJ3 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ufl1Q8CCJ3 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ufl1Q8CCJ3 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Ufl1Q8CCJ3 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.02■□□□□ -0
Ufl1Q8CCJ3 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC15.02■□□□□ -0
Ufl1Q8CCJ3 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ufl1Q8CCJ3 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ufl1Q8CCJ3 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ufl1Q8CCJ3 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ufl1Q8CCJ3 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ufl1Q8CCJ3 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ufl1Q8CCJ3 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ufl1Q8CCJ3 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ufl1Q8CCJ3 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Ufl1Q8CCJ3 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms