Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

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Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp38Q8BW70 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Usp38Q8BW70 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp38Q8BW70 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp38Q8BW70 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp38Q8BW70 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp38Q8BW70 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp38Q8BW70 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Usp38Q8BW70 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp38Q8BW70 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Usp38Q8BW70 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Usp38Q8BW70 4931419H13Rik-201ENSMUST00000199770 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Usp38Q8BW70 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp38Q8BW70 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp38Q8BW70 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp38Q8BW70 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp38Q8BW70 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp38Q8BW70 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp38Q8BW70 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp38Q8BW70 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp38Q8BW70 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp38Q8BW70 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp38Q8BW70 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp38Q8BW70 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp38Q8BW70 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp38Q8BW70 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp38Q8BW70 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp38Q8BW70 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp38Q8BW70 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp38Q8BW70 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp38Q8BW70 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp38Q8BW70 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp38Q8BW70 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp38Q8BW70 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp38Q8BW70 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp38Q8BW70 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp38Q8BW70 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
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