Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVA4

Lmod1, Leiomodin-1, mousemouse

Predictions only

Length 595 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod1Q8BVA4 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lmod1Q8BVA4 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lmod1Q8BVA4 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lmod1Q8BVA4 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lmod1Q8BVA4 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lmod1Q8BVA4 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Lmod1Q8BVA4 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lmod1Q8BVA4 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lmod1Q8BVA4 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lmod1Q8BVA4 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Lmod1Q8BVA4 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Lmod1Q8BVA4 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Lmod1Q8BVA4 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
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Lmod1Q8BVA4 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
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Lmod1Q8BVA4 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Lmod1Q8BVA4 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lmod1Q8BVA4 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lmod1Q8BVA4 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Lmod1Q8BVA4 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lmod1Q8BVA4 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Lmod1Q8BVA4 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lmod1Q8BVA4 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lmod1Q8BVA4 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lmod1Q8BVA4 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Lmod1Q8BVA4 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lmod1Q8BVA4 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
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Lmod1Q8BVA4 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Lmod1Q8BVA4 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Lmod1Q8BVA4 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lmod1Q8BVA4 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lmod1Q8BVA4 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Lmod1Q8BVA4 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lmod1Q8BVA4 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lmod1Q8BVA4 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lmod1Q8BVA4 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lmod1Q8BVA4 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Lmod1Q8BVA4 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lmod1Q8BVA4 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Lmod1Q8BVA4 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lmod1Q8BVA4 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lmod1Q8BVA4 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lmod1Q8BVA4 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lmod1Q8BVA4 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lmod1Q8BVA4 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lmod1Q8BVA4 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lmod1Q8BVA4 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lmod1Q8BVA4 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lmod1Q8BVA4 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lmod1Q8BVA4 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Lmod1Q8BVA4 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Lmod1Q8BVA4 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lmod1Q8BVA4 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lmod1Q8BVA4 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lmod1Q8BVA4 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lmod1Q8BVA4 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Lmod1Q8BVA4 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lmod1Q8BVA4 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lmod1Q8BVA4 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lmod1Q8BVA4 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lmod1Q8BVA4 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Lmod1Q8BVA4 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lmod1Q8BVA4 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lmod1Q8BVA4 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lmod1Q8BVA4 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lmod1Q8BVA4 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lmod1Q8BVA4 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Lmod1Q8BVA4 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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