Protein–RNA interactions for Protein: Q8BK35

Nop53, Ribosome biogenesis protein NOP53, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop53Q8BK35 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nop53Q8BK35 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nop53Q8BK35 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nop53Q8BK35 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nop53Q8BK35 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nop53Q8BK35 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nop53Q8BK35 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nop53Q8BK35 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nop53Q8BK35 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nop53Q8BK35 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nop53Q8BK35 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nop53Q8BK35 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nop53Q8BK35 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nop53Q8BK35 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nop53Q8BK35 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nop53Q8BK35 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Nop53Q8BK35 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nop53Q8BK35 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nop53Q8BK35 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nop53Q8BK35 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nop53Q8BK35 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nop53Q8BK35 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nop53Q8BK35 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Nop53Q8BK35 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Nop53Q8BK35 Gm16973-201ENSMUST00000180682 1299 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nop53Q8BK35 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Nop53Q8BK35 D530018E20Rik-201ENSMUST00000205107 958 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
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Nop53Q8BK35 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nop53Q8BK35 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Nop53Q8BK35 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nop53Q8BK35 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nop53Q8BK35 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nop53Q8BK35 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nop53Q8BK35 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nop53Q8BK35 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nop53Q8BK35 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nop53Q8BK35 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nop53Q8BK35 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nop53Q8BK35 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nop53Q8BK35 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nop53Q8BK35 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nop53Q8BK35 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nop53Q8BK35 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nop53Q8BK35 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
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Nop53Q8BK35 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nop53Q8BK35 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Nop53Q8BK35 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Nop53Q8BK35 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nop53Q8BK35 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nop53Q8BK35 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nop53Q8BK35 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nop53Q8BK35 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nop53Q8BK35 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Nop53Q8BK35 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nop53Q8BK35 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nop53Q8BK35 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Nop53Q8BK35 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nop53Q8BK35 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nop53Q8BK35 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nop53Q8BK35 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nop53Q8BK35 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nop53Q8BK35 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nop53Q8BK35 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nop53Q8BK35 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nop53Q8BK35 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nop53Q8BK35 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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