Protein–RNA interactions for Protein: Q80XK6

Atg2b, Autophagy-related protein 2 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 2,075 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg2bQ80XK6 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Atg2bQ80XK6 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Atg2bQ80XK6 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Atg2bQ80XK6 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Atg2bQ80XK6 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Atg2bQ80XK6 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Atg2bQ80XK6 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Atg2bQ80XK6 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Atg2bQ80XK6 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Atg2bQ80XK6 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Atg2bQ80XK6 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Atg2bQ80XK6 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Atg2bQ80XK6 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Atg2bQ80XK6 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Atg2bQ80XK6 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Atg2bQ80XK6 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Atg2bQ80XK6 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Atg2bQ80XK6 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Atg2bQ80XK6 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Atg2bQ80XK6 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Atg2bQ80XK6 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Atg2bQ80XK6 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Atg2bQ80XK6 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Atg2bQ80XK6 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Atg2bQ80XK6 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Atg2bQ80XK6 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Atg2bQ80XK6 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Atg2bQ80XK6 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Atg2bQ80XK6 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Atg2bQ80XK6 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Atg2bQ80XK6 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Atg2bQ80XK6 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Atg2bQ80XK6 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Atg2bQ80XK6 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Atg2bQ80XK6 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Atg2bQ80XK6 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Atg2bQ80XK6 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Atg2bQ80XK6 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Atg2bQ80XK6 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Atg2bQ80XK6 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Atg2bQ80XK6 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Atg2bQ80XK6 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Atg2bQ80XK6 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Atg2bQ80XK6 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Atg2bQ80XK6 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Atg2bQ80XK6 Gm6485-201ENSMUST00000160676 439 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Atg2bQ80XK6 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Atg2bQ80XK6 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Atg2bQ80XK6 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Atg2bQ80XK6 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Atg2bQ80XK6 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Atg2bQ80XK6 Gm10752-201ENSMUST00000218348 729 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Atg2bQ80XK6 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Atg2bQ80XK6 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Atg2bQ80XK6 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Atg2bQ80XK6 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Atg2bQ80XK6 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Atg2bQ80XK6 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Atg2bQ80XK6 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Atg2bQ80XK6 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Atg2bQ80XK6 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Atg2bQ80XK6 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Atg2bQ80XK6 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Atg2bQ80XK6 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Atg2bQ80XK6 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Atg2bQ80XK6 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Atg2bQ80XK6 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Atg2bQ80XK6 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Atg2bQ80XK6 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Atg2bQ80XK6 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Atg2bQ80XK6 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Atg2bQ80XK6 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Atg2bQ80XK6 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Atg2bQ80XK6 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Atg2bQ80XK6 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Atg2bQ80XK6 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Atg2bQ80XK6 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Atg2bQ80XK6 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Atg2bQ80XK6 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Atg2bQ80XK6 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Atg2bQ80XK6 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Atg2bQ80XK6 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Atg2bQ80XK6 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Atg2bQ80XK6 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Atg2bQ80XK6 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Atg2bQ80XK6 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Atg2bQ80XK6 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Atg2bQ80XK6 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Atg2bQ80XK6 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Atg2bQ80XK6 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Atg2bQ80XK6 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Atg2bQ80XK6 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Atg2bQ80XK6 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Atg2bQ80XK6 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Atg2bQ80XK6 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Atg2bQ80XK6 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Atg2bQ80XK6 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Atg2bQ80XK6 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Atg2bQ80XK6 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Atg2bQ80XK6 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms