Protein–RNA interactions for Protein: Q80VR2

Ell3, RNA polymerase II elongation factor ELL3, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ell3Q80VR2 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Fam180a-201ENSMUST00000051176 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Gm12333-201ENSMUST00000155508 2669 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Hcrtr2-203ENSMUST00000184757 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Slc10a7-202ENSMUST00000209490 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Gm37447-201ENSMUST00000195625 2928 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Mpp1-202ENSMUST00000114091 1558 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Nfyc-204ENSMUST00000120779 2006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms