Protein–RNA interactions for Protein: Q7TQ95

Lnpk, Endoplasmic reticulum junction formation protein lunapark, mousemouse

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Length 425 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LnpkQ7TQ95 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LnpkQ7TQ95 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LnpkQ7TQ95 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LnpkQ7TQ95 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LnpkQ7TQ95 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LnpkQ7TQ95 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LnpkQ7TQ95 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LnpkQ7TQ95 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LnpkQ7TQ95 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LnpkQ7TQ95 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LnpkQ7TQ95 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LnpkQ7TQ95 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
LnpkQ7TQ95 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
LnpkQ7TQ95 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LnpkQ7TQ95 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LnpkQ7TQ95 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LnpkQ7TQ95 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LnpkQ7TQ95 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LnpkQ7TQ95 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LnpkQ7TQ95 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LnpkQ7TQ95 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LnpkQ7TQ95 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LnpkQ7TQ95 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LnpkQ7TQ95 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
LnpkQ7TQ95 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LnpkQ7TQ95 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
LnpkQ7TQ95 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LnpkQ7TQ95 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LnpkQ7TQ95 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
LnpkQ7TQ95 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
LnpkQ7TQ95 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LnpkQ7TQ95 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LnpkQ7TQ95 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LnpkQ7TQ95 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LnpkQ7TQ95 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LnpkQ7TQ95 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LnpkQ7TQ95 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LnpkQ7TQ95 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LnpkQ7TQ95 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LnpkQ7TQ95 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LnpkQ7TQ95 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LnpkQ7TQ95 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LnpkQ7TQ95 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LnpkQ7TQ95 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LnpkQ7TQ95 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LnpkQ7TQ95 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LnpkQ7TQ95 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LnpkQ7TQ95 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LnpkQ7TQ95 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
LnpkQ7TQ95 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
LnpkQ7TQ95 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LnpkQ7TQ95 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LnpkQ7TQ95 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LnpkQ7TQ95 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LnpkQ7TQ95 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LnpkQ7TQ95 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LnpkQ7TQ95 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LnpkQ7TQ95 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LnpkQ7TQ95 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LnpkQ7TQ95 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LnpkQ7TQ95 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LnpkQ7TQ95 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LnpkQ7TQ95 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LnpkQ7TQ95 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LnpkQ7TQ95 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LnpkQ7TQ95 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LnpkQ7TQ95 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LnpkQ7TQ95 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
LnpkQ7TQ95 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
LnpkQ7TQ95 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LnpkQ7TQ95 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LnpkQ7TQ95 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LnpkQ7TQ95 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LnpkQ7TQ95 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LnpkQ7TQ95 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LnpkQ7TQ95 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LnpkQ7TQ95 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LnpkQ7TQ95 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LnpkQ7TQ95 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LnpkQ7TQ95 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LnpkQ7TQ95 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LnpkQ7TQ95 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LnpkQ7TQ95 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LnpkQ7TQ95 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LnpkQ7TQ95 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LnpkQ7TQ95 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LnpkQ7TQ95 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LnpkQ7TQ95 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LnpkQ7TQ95 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LnpkQ7TQ95 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LnpkQ7TQ95 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LnpkQ7TQ95 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LnpkQ7TQ95 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LnpkQ7TQ95 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LnpkQ7TQ95 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
LnpkQ7TQ95 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LnpkQ7TQ95 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LnpkQ7TQ95 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LnpkQ7TQ95 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LnpkQ7TQ95 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms