Protein–RNA interactions for Protein: Q7TQ33

Rgmb, RGM domain family member B, mousemouse

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Length 436 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RgmbQ7TQ33 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
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RgmbQ7TQ33 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RgmbQ7TQ33 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RgmbQ7TQ33 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RgmbQ7TQ33 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RgmbQ7TQ33 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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RgmbQ7TQ33 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RgmbQ7TQ33 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RgmbQ7TQ33 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RgmbQ7TQ33 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RgmbQ7TQ33 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RgmbQ7TQ33 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RgmbQ7TQ33 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RgmbQ7TQ33 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RgmbQ7TQ33 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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RgmbQ7TQ33 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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RgmbQ7TQ33 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RgmbQ7TQ33 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RgmbQ7TQ33 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RgmbQ7TQ33 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RgmbQ7TQ33 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RgmbQ7TQ33 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RgmbQ7TQ33 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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RgmbQ7TQ33 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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RgmbQ7TQ33 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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RgmbQ7TQ33 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RgmbQ7TQ33 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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RgmbQ7TQ33 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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RgmbQ7TQ33 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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RgmbQ7TQ33 Gadd45a-206ENSMUST00000204282 460 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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RgmbQ7TQ33 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RgmbQ7TQ33 Snu13-202ENSMUST00000080622 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.6 ms