Protein–RNA interactions for Protein: Q78IS1

Tmed3, Transmembrane emp24 domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed3Q78IS1 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Scnn1b-201ENSMUST00000033161 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Col6a3-202ENSMUST00000097653 9001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Ablim2-206ENSMUST00000114206 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Mpl-202ENSMUST00000102671 2934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Sorbs3-201ENSMUST00000022682 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Chic1-201ENSMUST00000116547 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Arhgap15os-201ENSMUST00000139948 1761 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Mical3-217ENSMUST00000207889 9204 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 9030624J02Rik-202ENSMUST00000059390 5097 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Gm15567-201ENSMUST00000148699 2130 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Chrnb2-203ENSMUST00000200558 3482 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Man2b2-201ENSMUST00000031002 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Araf-201ENSMUST00000001155 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Itgb2-201ENSMUST00000000299 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Myh1-202ENSMUST00000075734 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Igkv2-116-201ENSMUST00000199327 362 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Gm26868-201ENSMUST00000181927 2655 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Sec16a-201ENSMUST00000091252 8737 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Bcl7a-202ENSMUST00000117971 4642 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Otog-201ENSMUST00000164538 10043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Plekhn1-204ENSMUST00000218699 3196 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Tube1-201ENSMUST00000019991 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Uba1-201ENSMUST00000001989 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Atg14-202ENSMUST00000226299 3729 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Tnip1-206ENSMUST00000108889 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Mtf1-202ENSMUST00000106193 7554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.1 ms