Protein–RNA interactions for Protein: Q76I25

Higd1c, HIG1 domain family member 1C, mousemouse

Predictions only

Length 96 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1cQ76I25 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Higd1cQ76I25 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Higd1cQ76I25 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Higd1cQ76I25 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Higd1cQ76I25 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Higd1cQ76I25 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Higd1cQ76I25 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Higd1cQ76I25 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Higd1cQ76I25 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Higd1cQ76I25 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Higd1cQ76I25 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Higd1cQ76I25 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Higd1cQ76I25 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Higd1cQ76I25 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Higd1cQ76I25 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Higd1cQ76I25 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Higd1cQ76I25 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Higd1cQ76I25 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Higd1cQ76I25 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Higd1cQ76I25 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Higd1cQ76I25 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Higd1cQ76I25 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Higd1cQ76I25 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Higd1cQ76I25 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Higd1cQ76I25 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Higd1cQ76I25 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Higd1cQ76I25 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Higd1cQ76I25 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Higd1cQ76I25 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Higd1cQ76I25 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Higd1cQ76I25 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Higd1cQ76I25 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Higd1cQ76I25 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Higd1cQ76I25 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Higd1cQ76I25 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Higd1cQ76I25 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Higd1cQ76I25 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Higd1cQ76I25 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Higd1cQ76I25 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Higd1cQ76I25 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Higd1cQ76I25 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Higd1cQ76I25 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Higd1cQ76I25 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Higd1cQ76I25 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Higd1cQ76I25 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Higd1cQ76I25 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Higd1cQ76I25 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Higd1cQ76I25 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Higd1cQ76I25 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Higd1cQ76I25 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Higd1cQ76I25 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Higd1cQ76I25 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Higd1cQ76I25 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Higd1cQ76I25 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Higd1cQ76I25 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Higd1cQ76I25 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Higd1cQ76I25 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Higd1cQ76I25 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Higd1cQ76I25 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Higd1cQ76I25 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Higd1cQ76I25 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Higd1cQ76I25 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Higd1cQ76I25 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Higd1cQ76I25 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Higd1cQ76I25 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Higd1cQ76I25 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Higd1cQ76I25 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Higd1cQ76I25 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Higd1cQ76I25 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Higd1cQ76I25 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Higd1cQ76I25 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Higd1cQ76I25 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Higd1cQ76I25 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Higd1cQ76I25 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Higd1cQ76I25 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Higd1cQ76I25 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Higd1cQ76I25 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Higd1cQ76I25 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Higd1cQ76I25 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Higd1cQ76I25 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Higd1cQ76I25 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Higd1cQ76I25 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Higd1cQ76I25 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Higd1cQ76I25 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Higd1cQ76I25 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Higd1cQ76I25 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Higd1cQ76I25 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Higd1cQ76I25 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Higd1cQ76I25 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Higd1cQ76I25 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Higd1cQ76I25 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Higd1cQ76I25 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Higd1cQ76I25 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Higd1cQ76I25 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Higd1cQ76I25 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Higd1cQ76I25 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Higd1cQ76I25 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Higd1cQ76I25 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Higd1cQ76I25 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Higd1cQ76I25 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.7 ms