Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQF0

Topbp1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Topbp1Q6ZQF0 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Topbp1Q6ZQF0 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Topbp1Q6ZQF0 Krtap4-6-201ENSMUST00000100476 918 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Topbp1Q6ZQF0 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Topbp1Q6ZQF0 Gm25545-201ENSMUST00000122673 323 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Topbp1Q6ZQF0 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Topbp1Q6ZQF0 Eef1b2-209ENSMUST00000188524 681 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Topbp1Q6ZQF0 Gm18059-201ENSMUST00000208073 580 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Topbp1Q6ZQF0 Sdf2-201ENSMUST00000002133 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Topbp1Q6ZQF0 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Topbp1Q6ZQF0 Gm16380-201ENSMUST00000077997 478 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Topbp1Q6ZQF0 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Topbp1Q6ZQF0 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Topbp1Q6ZQF0 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Topbp1Q6ZQF0 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Topbp1Q6ZQF0 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Topbp1Q6ZQF0 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Topbp1Q6ZQF0 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Topbp1Q6ZQF0 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Topbp1Q6ZQF0 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Topbp1Q6ZQF0 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Topbp1Q6ZQF0 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Topbp1Q6ZQF0 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Topbp1Q6ZQF0 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Topbp1Q6ZQF0 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Topbp1Q6ZQF0 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Topbp1Q6ZQF0 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Topbp1Q6ZQF0 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Topbp1Q6ZQF0 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Topbp1Q6ZQF0 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Topbp1Q6ZQF0 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Topbp1Q6ZQF0 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Topbp1Q6ZQF0 Krtap4-9-201ENSMUST00000105059 1059 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Topbp1Q6ZQF0 Nudt6-203ENSMUST00000108117 879 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Topbp1Q6ZQF0 Gm20400-201ENSMUST00000173695 665 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Topbp1Q6ZQF0 Gm19015-201ENSMUST00000184002 1189 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Topbp1Q6ZQF0 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Topbp1Q6ZQF0 Gm18968-201ENSMUST00000221319 862 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Topbp1Q6ZQF0 Rpl3l-201ENSMUST00000045186 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Topbp1Q6ZQF0 Ndufaf1-203ENSMUST00000110802 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Topbp1Q6ZQF0 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Topbp1Q6ZQF0 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Topbp1Q6ZQF0 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Topbp1Q6ZQF0 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Topbp1Q6ZQF0 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Topbp1Q6ZQF0 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Topbp1Q6ZQF0 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Topbp1Q6ZQF0 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Topbp1Q6ZQF0 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Topbp1Q6ZQF0 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Topbp1Q6ZQF0 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Topbp1Q6ZQF0 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Topbp1Q6ZQF0 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Topbp1Q6ZQF0 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Topbp1Q6ZQF0 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Topbp1Q6ZQF0 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Topbp1Q6ZQF0 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Topbp1Q6ZQF0 Churc1-203ENSMUST00000126408 462 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Topbp1Q6ZQF0 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Topbp1Q6ZQF0 Gm22877-201ENSMUST00000175451 105 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Topbp1Q6ZQF0 AC168279.1-201ENSMUST00000214611 382 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Topbp1Q6ZQF0 Stt3a-209ENSMUST00000217599 285 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Topbp1Q6ZQF0 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Topbp1Q6ZQF0 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Topbp1Q6ZQF0 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Topbp1Q6ZQF0 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Topbp1Q6ZQF0 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Topbp1Q6ZQF0 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Topbp1Q6ZQF0 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Topbp1Q6ZQF0 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Topbp1Q6ZQF0 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Topbp1Q6ZQF0 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Topbp1Q6ZQF0 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Topbp1Q6ZQF0 Ighv10-1-201ENSMUST00000103492 359 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Topbp1Q6ZQF0 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Topbp1Q6ZQF0 Tbata-203ENSMUST00000121297 1000 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Topbp1Q6ZQF0 2810403D21Rik-208ENSMUST00000153212 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Topbp1Q6ZQF0 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Topbp1Q6ZQF0 Olfr755-ps1-201ENSMUST00000173568 910 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Topbp1Q6ZQF0 E030018B13Rik-201ENSMUST00000177638 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Topbp1Q6ZQF0 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Topbp1Q6ZQF0 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Topbp1Q6ZQF0 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Topbp1Q6ZQF0 Gm7596-202ENSMUST00000202171 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Topbp1Q6ZQF0 Fabp6-201ENSMUST00000020672 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Topbp1Q6ZQF0 Gm45410-201ENSMUST00000211331 1093 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Topbp1Q6ZQF0 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Topbp1Q6ZQF0 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Topbp1Q6ZQF0 AC122346.3-201ENSMUST00000223983 306 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Topbp1Q6ZQF0 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Topbp1Q6ZQF0 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Topbp1Q6ZQF0 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Topbp1Q6ZQF0 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Topbp1Q6ZQF0 Gm4900-201ENSMUST00000222046 1628 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Topbp1Q6ZQF0 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Topbp1Q6ZQF0 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Topbp1Q6ZQF0 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Topbp1Q6ZQF0 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Topbp1Q6ZQF0 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Topbp1Q6ZQF0 Chac2-202ENSMUST00000101394 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms