Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCS8

Zbtb40, Zinc finger and BTB domain-containing 40, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb40Q6PCS8 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zbtb40Q6PCS8 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zbtb40Q6PCS8 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zbtb40Q6PCS8 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zbtb40Q6PCS8 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Zbtb40Q6PCS8 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zbtb40Q6PCS8 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zbtb40Q6PCS8 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zbtb40Q6PCS8 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zbtb40Q6PCS8 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zbtb40Q6PCS8 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zbtb40Q6PCS8 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zbtb40Q6PCS8 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zbtb40Q6PCS8 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zbtb40Q6PCS8 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Zbtb40Q6PCS8 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Zbtb40Q6PCS8 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Zbtb40Q6PCS8 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Zbtb40Q6PCS8 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zbtb40Q6PCS8 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zbtb40Q6PCS8 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zbtb40Q6PCS8 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zbtb40Q6PCS8 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zbtb40Q6PCS8 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zbtb40Q6PCS8 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zbtb40Q6PCS8 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zbtb40Q6PCS8 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zbtb40Q6PCS8 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zbtb40Q6PCS8 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zbtb40Q6PCS8 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zbtb40Q6PCS8 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zbtb40Q6PCS8 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zbtb40Q6PCS8 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zbtb40Q6PCS8 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zbtb40Q6PCS8 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Zbtb40Q6PCS8 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Zbtb40Q6PCS8 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zbtb40Q6PCS8 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Zbtb40Q6PCS8 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zbtb40Q6PCS8 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zbtb40Q6PCS8 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zbtb40Q6PCS8 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zbtb40Q6PCS8 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zbtb40Q6PCS8 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zbtb40Q6PCS8 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zbtb40Q6PCS8 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zbtb40Q6PCS8 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zbtb40Q6PCS8 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zbtb40Q6PCS8 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zbtb40Q6PCS8 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zbtb40Q6PCS8 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zbtb40Q6PCS8 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zbtb40Q6PCS8 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zbtb40Q6PCS8 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zbtb40Q6PCS8 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zbtb40Q6PCS8 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zbtb40Q6PCS8 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zbtb40Q6PCS8 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zbtb40Q6PCS8 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zbtb40Q6PCS8 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zbtb40Q6PCS8 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zbtb40Q6PCS8 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zbtb40Q6PCS8 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zbtb40Q6PCS8 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zbtb40Q6PCS8 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zbtb40Q6PCS8 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zbtb40Q6PCS8 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zbtb40Q6PCS8 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zbtb40Q6PCS8 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zbtb40Q6PCS8 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zbtb40Q6PCS8 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zbtb40Q6PCS8 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zbtb40Q6PCS8 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zbtb40Q6PCS8 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zbtb40Q6PCS8 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zbtb40Q6PCS8 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zbtb40Q6PCS8 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zbtb40Q6PCS8 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zbtb40Q6PCS8 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zbtb40Q6PCS8 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zbtb40Q6PCS8 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zbtb40Q6PCS8 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zbtb40Q6PCS8 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zbtb40Q6PCS8 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zbtb40Q6PCS8 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zbtb40Q6PCS8 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zbtb40Q6PCS8 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zbtb40Q6PCS8 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Zbtb40Q6PCS8 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Zbtb40Q6PCS8 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Zbtb40Q6PCS8 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zbtb40Q6PCS8 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zbtb40Q6PCS8 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zbtb40Q6PCS8 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Zbtb40Q6PCS8 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zbtb40Q6PCS8 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zbtb40Q6PCS8 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zbtb40Q6PCS8 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zbtb40Q6PCS8 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zbtb40Q6PCS8 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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