Protein–RNA interactions for Protein: Q6KAU4

Mvb12b, Multivesicular body subunit 12B, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mvb12bQ6KAU4 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mvb12bQ6KAU4 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mvb12bQ6KAU4 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mvb12bQ6KAU4 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mvb12bQ6KAU4 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mvb12bQ6KAU4 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Mvb12bQ6KAU4 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mvb12bQ6KAU4 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mvb12bQ6KAU4 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mvb12bQ6KAU4 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mvb12bQ6KAU4 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mvb12bQ6KAU4 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mvb12bQ6KAU4 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mvb12bQ6KAU4 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mvb12bQ6KAU4 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mvb12bQ6KAU4 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mvb12bQ6KAU4 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mvb12bQ6KAU4 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mvb12bQ6KAU4 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mvb12bQ6KAU4 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mvb12bQ6KAU4 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mvb12bQ6KAU4 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mvb12bQ6KAU4 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mvb12bQ6KAU4 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mvb12bQ6KAU4 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mvb12bQ6KAU4 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mvb12bQ6KAU4 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mvb12bQ6KAU4 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Mvb12bQ6KAU4 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mvb12bQ6KAU4 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mvb12bQ6KAU4 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mvb12bQ6KAU4 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mvb12bQ6KAU4 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mvb12bQ6KAU4 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mvb12bQ6KAU4 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mvb12bQ6KAU4 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mvb12bQ6KAU4 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mvb12bQ6KAU4 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mvb12bQ6KAU4 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Mvb12bQ6KAU4 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mvb12bQ6KAU4 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mvb12bQ6KAU4 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Mvb12bQ6KAU4 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mvb12bQ6KAU4 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mvb12bQ6KAU4 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Mvb12bQ6KAU4 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mvb12bQ6KAU4 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mvb12bQ6KAU4 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Mvb12bQ6KAU4 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mvb12bQ6KAU4 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mvb12bQ6KAU4 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mvb12bQ6KAU4 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mvb12bQ6KAU4 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mvb12bQ6KAU4 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mvb12bQ6KAU4 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mvb12bQ6KAU4 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mvb12bQ6KAU4 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mvb12bQ6KAU4 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mvb12bQ6KAU4 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mvb12bQ6KAU4 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mvb12bQ6KAU4 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mvb12bQ6KAU4 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mvb12bQ6KAU4 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mvb12bQ6KAU4 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mvb12bQ6KAU4 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mvb12bQ6KAU4 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mvb12bQ6KAU4 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Mvb12bQ6KAU4 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mvb12bQ6KAU4 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mvb12bQ6KAU4 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mvb12bQ6KAU4 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mvb12bQ6KAU4 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mvb12bQ6KAU4 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mvb12bQ6KAU4 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mvb12bQ6KAU4 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Mvb12bQ6KAU4 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mvb12bQ6KAU4 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mvb12bQ6KAU4 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Mvb12bQ6KAU4 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mvb12bQ6KAU4 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mvb12bQ6KAU4 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mvb12bQ6KAU4 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mvb12bQ6KAU4 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mvb12bQ6KAU4 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mvb12bQ6KAU4 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mvb12bQ6KAU4 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mvb12bQ6KAU4 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mvb12bQ6KAU4 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mvb12bQ6KAU4 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mvb12bQ6KAU4 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mvb12bQ6KAU4 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mvb12bQ6KAU4 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mvb12bQ6KAU4 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mvb12bQ6KAU4 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mvb12bQ6KAU4 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mvb12bQ6KAU4 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mvb12bQ6KAU4 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Mvb12bQ6KAU4 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mvb12bQ6KAU4 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mvb12bQ6KAU4 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms