Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX3

Krt40, Keratin, type I cytoskeletal 40, mousemouse

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Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt40Q6IFX3 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Krt40Q6IFX3 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Krt40Q6IFX3 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Krt40Q6IFX3 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Krt40Q6IFX3 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Krt40Q6IFX3 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Krt40Q6IFX3 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Krt40Q6IFX3 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Krt40Q6IFX3 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Krt40Q6IFX3 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Krt40Q6IFX3 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Krt40Q6IFX3 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Krt40Q6IFX3 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Krt40Q6IFX3 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Krt40Q6IFX3 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Krt40Q6IFX3 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Krt40Q6IFX3 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Krt40Q6IFX3 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Krt40Q6IFX3 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Krt40Q6IFX3 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Krt40Q6IFX3 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Krt40Q6IFX3 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Krt40Q6IFX3 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Krt40Q6IFX3 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Krt40Q6IFX3 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Krt40Q6IFX3 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Krt40Q6IFX3 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Krt40Q6IFX3 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Krt40Q6IFX3 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Krt40Q6IFX3 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Krt40Q6IFX3 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Krt40Q6IFX3 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Krt40Q6IFX3 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Krt40Q6IFX3 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Krt40Q6IFX3 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Krt40Q6IFX3 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Krt40Q6IFX3 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Krt40Q6IFX3 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Krt40Q6IFX3 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Krt40Q6IFX3 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Krt40Q6IFX3 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Krt40Q6IFX3 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Krt40Q6IFX3 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Krt40Q6IFX3 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Krt40Q6IFX3 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Krt40Q6IFX3 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Krt40Q6IFX3 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Krt40Q6IFX3 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Krt40Q6IFX3 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Krt40Q6IFX3 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Krt40Q6IFX3 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Krt40Q6IFX3 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Krt40Q6IFX3 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Krt40Q6IFX3 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Krt40Q6IFX3 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Krt40Q6IFX3 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Krt40Q6IFX3 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Krt40Q6IFX3 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Krt40Q6IFX3 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Krt40Q6IFX3 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Krt40Q6IFX3 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Krt40Q6IFX3 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Krt40Q6IFX3 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Krt40Q6IFX3 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Krt40Q6IFX3 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Krt40Q6IFX3 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Krt40Q6IFX3 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Krt40Q6IFX3 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Krt40Q6IFX3 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Krt40Q6IFX3 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Krt40Q6IFX3 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Krt40Q6IFX3 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Krt40Q6IFX3 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Krt40Q6IFX3 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Krt40Q6IFX3 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Krt40Q6IFX3 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Krt40Q6IFX3 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Krt40Q6IFX3 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Krt40Q6IFX3 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Krt40Q6IFX3 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Krt40Q6IFX3 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Krt40Q6IFX3 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Krt40Q6IFX3 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Krt40Q6IFX3 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Krt40Q6IFX3 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Krt40Q6IFX3 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Krt40Q6IFX3 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Krt40Q6IFX3 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Krt40Q6IFX3 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Krt40Q6IFX3 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Krt40Q6IFX3 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Krt40Q6IFX3 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Krt40Q6IFX3 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Krt40Q6IFX3 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Krt40Q6IFX3 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Krt40Q6IFX3 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Krt40Q6IFX3 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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