Protein–RNA interactions for Protein: Q6EBV9

Atg9b, Autophagy-related protein 9B, mousemouse

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Length 922 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9bQ6EBV9 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Atg9bQ6EBV9 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Atg9bQ6EBV9 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Atg9bQ6EBV9 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Atg9bQ6EBV9 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Atg9bQ6EBV9 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Atg9bQ6EBV9 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Atg9bQ6EBV9 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Atg9bQ6EBV9 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Atg9bQ6EBV9 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Atg9bQ6EBV9 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Atg9bQ6EBV9 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Atg9bQ6EBV9 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Atg9bQ6EBV9 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Atg9bQ6EBV9 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Atg9bQ6EBV9 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Atg9bQ6EBV9 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Atg9bQ6EBV9 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Atg9bQ6EBV9 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Atg9bQ6EBV9 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Atg9bQ6EBV9 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Atg9bQ6EBV9 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Atg9bQ6EBV9 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Atg9bQ6EBV9 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Atg9bQ6EBV9 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Atg9bQ6EBV9 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Atg9bQ6EBV9 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Atg9bQ6EBV9 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Atg9bQ6EBV9 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Atg9bQ6EBV9 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Atg9bQ6EBV9 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Atg9bQ6EBV9 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Atg9bQ6EBV9 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Atg9bQ6EBV9 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Atg9bQ6EBV9 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Atg9bQ6EBV9 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Atg9bQ6EBV9 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Atg9bQ6EBV9 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Atg9bQ6EBV9 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Atg9bQ6EBV9 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Atg9bQ6EBV9 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Atg9bQ6EBV9 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Atg9bQ6EBV9 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Atg9bQ6EBV9 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Atg9bQ6EBV9 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Atg9bQ6EBV9 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Atg9bQ6EBV9 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Atg9bQ6EBV9 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Atg9bQ6EBV9 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Atg9bQ6EBV9 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Atg9bQ6EBV9 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
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Atg9bQ6EBV9 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Atg9bQ6EBV9 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Atg9bQ6EBV9 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Atg9bQ6EBV9 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Atg9bQ6EBV9 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Atg9bQ6EBV9 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Atg9bQ6EBV9 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Atg9bQ6EBV9 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Atg9bQ6EBV9 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Atg9bQ6EBV9 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Atg9bQ6EBV9 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Atg9bQ6EBV9 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Atg9bQ6EBV9 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Atg9bQ6EBV9 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Atg9bQ6EBV9 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Atg9bQ6EBV9 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
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Atg9bQ6EBV9 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Atg9bQ6EBV9 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Atg9bQ6EBV9 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Atg9bQ6EBV9 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Atg9bQ6EBV9 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Atg9bQ6EBV9 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Atg9bQ6EBV9 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Atg9bQ6EBV9 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Atg9bQ6EBV9 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Atg9bQ6EBV9 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Atg9bQ6EBV9 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Atg9bQ6EBV9 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Atg9bQ6EBV9 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Atg9bQ6EBV9 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Atg9bQ6EBV9 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Atg9bQ6EBV9 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Atg9bQ6EBV9 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Atg9bQ6EBV9 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Atg9bQ6EBV9 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Atg9bQ6EBV9 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Atg9bQ6EBV9 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Atg9bQ6EBV9 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Atg9bQ6EBV9 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Atg9bQ6EBV9 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Atg9bQ6EBV9 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Atg9bQ6EBV9 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Atg9bQ6EBV9 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Atg9bQ6EBV9 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Atg9bQ6EBV9 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Atg9bQ6EBV9 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Atg9bQ6EBV9 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms