Protein–RNA interactions for Protein: Q62311

Taf6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 678 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf6Q62311 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Taf6Q62311 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Taf6Q62311 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Taf6Q62311 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Taf6Q62311 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Taf6Q62311 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Taf6Q62311 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Taf6Q62311 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Taf6Q62311 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Taf6Q62311 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Taf6Q62311 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Taf6Q62311 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Taf6Q62311 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Taf6Q62311 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Taf6Q62311 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Taf6Q62311 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Taf6Q62311 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Taf6Q62311 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Taf6Q62311 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Taf6Q62311 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Taf6Q62311 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Taf6Q62311 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Taf6Q62311 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Taf6Q62311 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Taf6Q62311 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Taf6Q62311 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Taf6Q62311 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Taf6Q62311 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Taf6Q62311 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Taf6Q62311 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Taf6Q62311 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Taf6Q62311 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Taf6Q62311 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Taf6Q62311 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Taf6Q62311 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Taf6Q62311 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Taf6Q62311 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Taf6Q62311 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Taf6Q62311 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Taf6Q62311 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Taf6Q62311 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Taf6Q62311 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Taf6Q62311 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Taf6Q62311 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Taf6Q62311 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Taf6Q62311 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Taf6Q62311 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Taf6Q62311 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Taf6Q62311 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Taf6Q62311 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Taf6Q62311 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Taf6Q62311 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Taf6Q62311 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Taf6Q62311 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Taf6Q62311 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Taf6Q62311 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Taf6Q62311 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Taf6Q62311 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Taf6Q62311 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Taf6Q62311 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Taf6Q62311 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Taf6Q62311 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Taf6Q62311 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
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Taf6Q62311 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
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Taf6Q62311 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Taf6Q62311 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
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Taf6Q62311 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Taf6Q62311 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Taf6Q62311 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Taf6Q62311 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Taf6Q62311 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Taf6Q62311 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Taf6Q62311 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Taf6Q62311 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Taf6Q62311 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Taf6Q62311 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Taf6Q62311 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Taf6Q62311 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Taf6Q62311 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Taf6Q62311 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Taf6Q62311 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.59
Taf6Q62311 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Taf6Q62311 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Taf6Q62311 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Taf6Q62311 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Taf6Q62311 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Taf6Q62311 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Taf6Q62311 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Taf6Q62311 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Taf6Q62311 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Taf6Q62311 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Taf6Q62311 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Taf6Q62311 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.6 ms