Protein–RNA interactions for Protein: Q60980

Klf3, Krueppel-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf3Q60980 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.8 ms