Protein–RNA interactions for Protein: Q60952

Cep250, Centrosome-associated protein CEP250, mousemouse

Predictions only

Length 2,414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep250Q60952 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cep250Q60952 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cep250Q60952 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cep250Q60952 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cep250Q60952 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cep250Q60952 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cep250Q60952 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cep250Q60952 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cep250Q60952 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cep250Q60952 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cep250Q60952 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cep250Q60952 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cep250Q60952 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cep250Q60952 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cep250Q60952 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cep250Q60952 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cep250Q60952 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cep250Q60952 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cep250Q60952 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cep250Q60952 Marcksl1-ps4-201ENSMUST00000132531 291 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Cep250Q60952 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cep250Q60952 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cep250Q60952 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cep250Q60952 2610316D01Rik-201ENSMUST00000181047 924 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cep250Q60952 Dnajb6-212ENSMUST00000198694 505 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cep250Q60952 Gm6145-204ENSMUST00000210902 1266 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cep250Q60952 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Cep250Q60952 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cep250Q60952 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cep250Q60952 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cep250Q60952 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cep250Q60952 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cep250Q60952 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cep250Q60952 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cep250Q60952 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cep250Q60952 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cep250Q60952 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cep250Q60952 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cep250Q60952 Zfp809-201ENSMUST00000072465 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cep250Q60952 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cep250Q60952 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cep250Q60952 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cep250Q60952 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cep250Q60952 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cep250Q60952 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cep250Q60952 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Cep250Q60952 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Cep250Q60952 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cep250Q60952 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cep250Q60952 Rfc4-202ENSMUST00000115337 416 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cep250Q60952 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Cep250Q60952 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Cep250Q60952 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cep250Q60952 Agtpbp1-219ENSMUST00000170378 653 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cep250Q60952 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Cep250Q60952 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cep250Q60952 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cep250Q60952 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Cep250Q60952 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cep250Q60952 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cep250Q60952 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Cep250Q60952 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cep250Q60952 1810009A15Rik-201ENSMUST00000096251 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cep250Q60952 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cep250Q60952 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cep250Q60952 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Cep250Q60952 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cep250Q60952 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cep250Q60952 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cep250Q60952 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cep250Q60952 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cep250Q60952 Rabggtb-202ENSMUST00000167111 1418 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cep250Q60952 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cep250Q60952 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cep250Q60952 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cep250Q60952 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cep250Q60952 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cep250Q60952 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cep250Q60952 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cep250Q60952 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cep250Q60952 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Cep250Q60952 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cep250Q60952 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cep250Q60952 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cep250Q60952 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cep250Q60952 Churc1-203ENSMUST00000126408 462 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cep250Q60952 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cep250Q60952 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cep250Q60952 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Cep250Q60952 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cep250Q60952 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cep250Q60952 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cep250Q60952 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cep250Q60952 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cep250Q60952 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cep250Q60952 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cep250Q60952 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cep250Q60952 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cep250Q60952 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cep250Q60952 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms