Protein–RNA interactions for Protein: Q60809

Cnot7, CCR4-NOT transcription complex subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot7Q60809 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnot7Q60809 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnot7Q60809 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnot7Q60809 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnot7Q60809 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnot7Q60809 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnot7Q60809 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnot7Q60809 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnot7Q60809 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnot7Q60809 Trpm2-201ENSMUST00000105399 731 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnot7Q60809 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnot7Q60809 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnot7Q60809 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnot7Q60809 Rn7s6-201ENSMUST00000175005 291 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnot7Q60809 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnot7Q60809 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnot7Q60809 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnot7Q60809 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnot7Q60809 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnot7Q60809 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnot7Q60809 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnot7Q60809 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnot7Q60809 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnot7Q60809 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnot7Q60809 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnot7Q60809 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnot7Q60809 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnot7Q60809 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnot7Q60809 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnot7Q60809 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnot7Q60809 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnot7Q60809 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnot7Q60809 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnot7Q60809 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnot7Q60809 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnot7Q60809 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnot7Q60809 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnot7Q60809 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnot7Q60809 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnot7Q60809 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnot7Q60809 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnot7Q60809 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnot7Q60809 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnot7Q60809 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnot7Q60809 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnot7Q60809 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnot7Q60809 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnot7Q60809 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnot7Q60809 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnot7Q60809 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnot7Q60809 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnot7Q60809 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnot7Q60809 Gm7535-201ENSMUST00000164167 909 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnot7Q60809 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnot7Q60809 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnot7Q60809 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnot7Q60809 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnot7Q60809 Gm28324-201ENSMUST00000187913 264 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnot7Q60809 Gm34023-201ENSMUST00000195539 217 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnot7Q60809 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnot7Q60809 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnot7Q60809 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnot7Q60809 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnot7Q60809 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnot7Q60809 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnot7Q60809 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnot7Q60809 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnot7Q60809 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnot7Q60809 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnot7Q60809 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnot7Q60809 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnot7Q60809 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnot7Q60809 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnot7Q60809 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnot7Q60809 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnot7Q60809 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnot7Q60809 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnot7Q60809 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnot7Q60809 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnot7Q60809 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnot7Q60809 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnot7Q60809 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnot7Q60809 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnot7Q60809 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnot7Q60809 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnot7Q60809 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnot7Q60809 Tulp2-202ENSMUST00000085331 1525 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnot7Q60809 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnot7Q60809 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnot7Q60809 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnot7Q60809 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnot7Q60809 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnot7Q60809 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnot7Q60809 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnot7Q60809 9430091E24Rik-201ENSMUST00000127301 1067 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnot7Q60809 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnot7Q60809 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnot7Q60809 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnot7Q60809 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnot7Q60809 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms