Protein–RNA interactions for Protein: Q60803

Traf3, TNF receptor-associated factor 3, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3Q60803 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Traf3Q60803 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Traf3Q60803 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Traf3Q60803 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Traf3Q60803 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Traf3Q60803 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Traf3Q60803 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Traf3Q60803 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Traf3Q60803 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Traf3Q60803 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Traf3Q60803 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Traf3Q60803 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Traf3Q60803 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Traf3Q60803 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Traf3Q60803 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Traf3Q60803 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Traf3Q60803 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Traf3Q60803 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Traf3Q60803 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Traf3Q60803 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Traf3Q60803 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Traf3Q60803 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC13.15□□□□□ -0.31
Traf3Q60803 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Traf3Q60803 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Traf3Q60803 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Traf3Q60803 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Traf3Q60803 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Traf3Q60803 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Traf3Q60803 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Traf3Q60803 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Traf3Q60803 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Traf3Q60803 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Traf3Q60803 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Traf3Q60803 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Traf3Q60803 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Traf3Q60803 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Traf3Q60803 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Traf3Q60803 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Traf3Q60803 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Traf3Q60803 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Traf3Q60803 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Traf3Q60803 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Traf3Q60803 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Traf3Q60803 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Traf3Q60803 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Traf3Q60803 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Traf3Q60803 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Traf3Q60803 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Traf3Q60803 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Traf3Q60803 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Traf3Q60803 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Traf3Q60803 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Traf3Q60803 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Traf3Q60803 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Traf3Q60803 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Traf3Q60803 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Traf3Q60803 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Traf3Q60803 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Traf3Q60803 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Traf3Q60803 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Traf3Q60803 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Traf3Q60803 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Traf3Q60803 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Traf3Q60803 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Traf3Q60803 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Traf3Q60803 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Traf3Q60803 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Traf3Q60803 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Traf3Q60803 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Traf3Q60803 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Traf3Q60803 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Traf3Q60803 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Traf3Q60803 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Traf3Q60803 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Traf3Q60803 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Traf3Q60803 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Traf3Q60803 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Traf3Q60803 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Traf3Q60803 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Traf3Q60803 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Traf3Q60803 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Traf3Q60803 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Traf3Q60803 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Traf3Q60803 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Traf3Q60803 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Traf3Q60803 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Traf3Q60803 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Traf3Q60803 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Traf3Q60803 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Traf3Q60803 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Traf3Q60803 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Traf3Q60803 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Traf3Q60803 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Traf3Q60803 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Traf3Q60803 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Traf3Q60803 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Traf3Q60803 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Traf3Q60803 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Traf3Q60803 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Traf3Q60803 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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