Protein–RNA interactions for Protein: Q60636

Prdm1, PR domain zinc finger protein 1, mousemouse

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Length 856 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm1Q60636 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Prdm1Q60636 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prdm1Q60636 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prdm1Q60636 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Prdm1Q60636 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Prdm1Q60636 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Prdm1Q60636 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Prdm1Q60636 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prdm1Q60636 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Prdm1Q60636 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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