Protein–RNA interactions for Protein: Q5VCS6

Tdrd5, Tudor domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,040 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd5Q5VCS6 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tdrd5Q5VCS6 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Tdrd5Q5VCS6 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Tdrd5Q5VCS6 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Tdrd5Q5VCS6 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Tdrd5Q5VCS6 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Tdrd5Q5VCS6 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Tdrd5Q5VCS6 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Tdrd5Q5VCS6 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Tdrd5Q5VCS6 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tdrd5Q5VCS6 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tdrd5Q5VCS6 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tdrd5Q5VCS6 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tdrd5Q5VCS6 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tdrd5Q5VCS6 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Tdrd5Q5VCS6 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tdrd5Q5VCS6 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Tdrd5Q5VCS6 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tdrd5Q5VCS6 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tdrd5Q5VCS6 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tdrd5Q5VCS6 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tdrd5Q5VCS6 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tdrd5Q5VCS6 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tdrd5Q5VCS6 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tdrd5Q5VCS6 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tdrd5Q5VCS6 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tdrd5Q5VCS6 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Tdrd5Q5VCS6 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tdrd5Q5VCS6 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tdrd5Q5VCS6 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tdrd5Q5VCS6 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tdrd5Q5VCS6 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tdrd5Q5VCS6 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tdrd5Q5VCS6 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tdrd5Q5VCS6 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tdrd5Q5VCS6 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tdrd5Q5VCS6 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tdrd5Q5VCS6 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tdrd5Q5VCS6 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tdrd5Q5VCS6 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tdrd5Q5VCS6 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tdrd5Q5VCS6 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tdrd5Q5VCS6 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tdrd5Q5VCS6 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tdrd5Q5VCS6 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tdrd5Q5VCS6 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tdrd5Q5VCS6 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tdrd5Q5VCS6 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tdrd5Q5VCS6 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tdrd5Q5VCS6 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tdrd5Q5VCS6 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tdrd5Q5VCS6 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tdrd5Q5VCS6 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tdrd5Q5VCS6 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Tdrd5Q5VCS6 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Tdrd5Q5VCS6 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Tdrd5Q5VCS6 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Tdrd5Q5VCS6 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tdrd5Q5VCS6 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Tdrd5Q5VCS6 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tdrd5Q5VCS6 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tdrd5Q5VCS6 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tdrd5Q5VCS6 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Tdrd5Q5VCS6 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tdrd5Q5VCS6 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tdrd5Q5VCS6 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tdrd5Q5VCS6 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tdrd5Q5VCS6 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tdrd5Q5VCS6 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tdrd5Q5VCS6 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tdrd5Q5VCS6 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tdrd5Q5VCS6 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tdrd5Q5VCS6 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tdrd5Q5VCS6 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tdrd5Q5VCS6 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tdrd5Q5VCS6 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tdrd5Q5VCS6 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tdrd5Q5VCS6 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tdrd5Q5VCS6 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tdrd5Q5VCS6 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tdrd5Q5VCS6 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tdrd5Q5VCS6 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tdrd5Q5VCS6 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tdrd5Q5VCS6 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tdrd5Q5VCS6 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tdrd5Q5VCS6 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tdrd5Q5VCS6 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tdrd5Q5VCS6 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tdrd5Q5VCS6 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tdrd5Q5VCS6 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Tdrd5Q5VCS6 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Tdrd5Q5VCS6 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tdrd5Q5VCS6 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tdrd5Q5VCS6 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Tdrd5Q5VCS6 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Tdrd5Q5VCS6 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tdrd5Q5VCS6 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Tdrd5Q5VCS6 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Tdrd5Q5VCS6 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Tdrd5Q5VCS6 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.2 ms