Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4D8

Slc5a6, Sodium-dependent multivitamin transporter, mousemouse

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a6Q5U4D8 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Slc5a6Q5U4D8 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Slc5a6Q5U4D8 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Slc5a6Q5U4D8 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Slc5a6Q5U4D8 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Slc5a6Q5U4D8 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Slc5a6Q5U4D8 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Slc5a6Q5U4D8 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Slc5a6Q5U4D8 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Slc5a6Q5U4D8 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Slc5a6Q5U4D8 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Slc5a6Q5U4D8 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Slc5a6Q5U4D8 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Slc5a6Q5U4D8 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Slc5a6Q5U4D8 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Slc5a6Q5U4D8 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Slc5a6Q5U4D8 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Slc5a6Q5U4D8 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Slc5a6Q5U4D8 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Slc5a6Q5U4D8 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Slc5a6Q5U4D8 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Slc5a6Q5U4D8 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Slc5a6Q5U4D8 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Slc5a6Q5U4D8 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Slc5a6Q5U4D8 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Slc5a6Q5U4D8 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Slc5a6Q5U4D8 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Slc5a6Q5U4D8 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Slc5a6Q5U4D8 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Slc5a6Q5U4D8 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Slc5a6Q5U4D8 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Slc5a6Q5U4D8 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Slc5a6Q5U4D8 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Slc5a6Q5U4D8 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Slc5a6Q5U4D8 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Slc5a6Q5U4D8 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Slc5a6Q5U4D8 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Slc5a6Q5U4D8 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Slc5a6Q5U4D8 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Slc5a6Q5U4D8 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Slc5a6Q5U4D8 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Slc5a6Q5U4D8 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Slc5a6Q5U4D8 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Slc5a6Q5U4D8 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Slc5a6Q5U4D8 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Slc5a6Q5U4D8 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Slc5a6Q5U4D8 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Slc5a6Q5U4D8 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Slc5a6Q5U4D8 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Slc5a6Q5U4D8 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Slc5a6Q5U4D8 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Slc5a6Q5U4D8 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Slc5a6Q5U4D8 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Slc5a6Q5U4D8 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Slc5a6Q5U4D8 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Slc5a6Q5U4D8 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Slc5a6Q5U4D8 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Slc5a6Q5U4D8 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Slc5a6Q5U4D8 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Slc5a6Q5U4D8 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Slc5a6Q5U4D8 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Slc5a6Q5U4D8 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Slc5a6Q5U4D8 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Slc5a6Q5U4D8 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Slc5a6Q5U4D8 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Slc5a6Q5U4D8 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Slc5a6Q5U4D8 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Slc5a6Q5U4D8 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Slc5a6Q5U4D8 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Slc5a6Q5U4D8 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Slc5a6Q5U4D8 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Slc5a6Q5U4D8 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Slc5a6Q5U4D8 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Slc5a6Q5U4D8 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Slc5a6Q5U4D8 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Slc5a6Q5U4D8 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Slc5a6Q5U4D8 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Slc5a6Q5U4D8 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Slc5a6Q5U4D8 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Slc5a6Q5U4D8 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Slc5a6Q5U4D8 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Slc5a6Q5U4D8 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Slc5a6Q5U4D8 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Slc5a6Q5U4D8 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Slc5a6Q5U4D8 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Slc5a6Q5U4D8 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Slc5a6Q5U4D8 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Slc5a6Q5U4D8 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Slc5a6Q5U4D8 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Slc5a6Q5U4D8 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Slc5a6Q5U4D8 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Slc5a6Q5U4D8 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Slc5a6Q5U4D8 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Slc5a6Q5U4D8 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Slc5a6Q5U4D8 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Slc5a6Q5U4D8 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Slc5a6Q5U4D8 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Slc5a6Q5U4D8 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Slc5a6Q5U4D8 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Slc5a6Q5U4D8 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms