Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWD9

Tsr1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, mousemouse

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Length 803 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr1Q5SWD9 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Tsr1Q5SWD9 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tsr1Q5SWD9 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tsr1Q5SWD9 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tsr1Q5SWD9 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tsr1Q5SWD9 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Tsr1Q5SWD9 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Tsr1Q5SWD9 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tsr1Q5SWD9 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Tsr1Q5SWD9 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tsr1Q5SWD9 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tsr1Q5SWD9 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
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Tsr1Q5SWD9 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
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Tsr1Q5SWD9 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tsr1Q5SWD9 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Tsr1Q5SWD9 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Tsr1Q5SWD9 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tsr1Q5SWD9 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tsr1Q5SWD9 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tsr1Q5SWD9 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
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