Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSZ5

Tns3, Tensin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tns3Q5SSZ5 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tns3Q5SSZ5 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tns3Q5SSZ5 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tns3Q5SSZ5 Gm12783-201ENSMUST00000121425 397 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Tns3Q5SSZ5 1810021B22Rik-201ENSMUST00000150364 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tns3Q5SSZ5 Zfp637-210ENSMUST00000164472 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tns3Q5SSZ5 Hcrtr1-204ENSMUST00000164887 1251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tns3Q5SSZ5 A930005H10Rik-204ENSMUST00000185681 625 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tns3Q5SSZ5 Iqcf3-202ENSMUST00000186668 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tns3Q5SSZ5 A930005H10Rik-206ENSMUST00000188260 739 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tns3Q5SSZ5 Gm28306-201ENSMUST00000191315 529 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tns3Q5SSZ5 Hils1-201ENSMUST00000038928 864 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tns3Q5SSZ5 Taar9-201ENSMUST00000041180 1047 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tns3Q5SSZ5 Gm5805-201ENSMUST00000072779 456 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Tns3Q5SSZ5 Taar8b-201ENSMUST00000092654 1035 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tns3Q5SSZ5 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tns3Q5SSZ5 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tns3Q5SSZ5 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tns3Q5SSZ5 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tns3Q5SSZ5 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tns3Q5SSZ5 Gm11470-201ENSMUST00000118868 1475 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Tns3Q5SSZ5 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tns3Q5SSZ5 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tns3Q5SSZ5 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tns3Q5SSZ5 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tns3Q5SSZ5 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tns3Q5SSZ5 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tns3Q5SSZ5 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Tns3Q5SSZ5 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tns3Q5SSZ5 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tns3Q5SSZ5 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tns3Q5SSZ5 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tns3Q5SSZ5 Gm16237-201ENSMUST00000156666 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tns3Q5SSZ5 Tbata-203ENSMUST00000121297 1000 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tns3Q5SSZ5 Gm21972-201ENSMUST00000135197 776 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tns3Q5SSZ5 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Tns3Q5SSZ5 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Tns3Q5SSZ5 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Tns3Q5SSZ5 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tns3Q5SSZ5 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Tns3Q5SSZ5 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Tns3Q5SSZ5 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tns3Q5SSZ5 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tns3Q5SSZ5 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Tns3Q5SSZ5 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tns3Q5SSZ5 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tns3Q5SSZ5 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tns3Q5SSZ5 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tns3Q5SSZ5 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tns3Q5SSZ5 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tns3Q5SSZ5 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tns3Q5SSZ5 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tns3Q5SSZ5 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Tns3Q5SSZ5 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tns3Q5SSZ5 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tns3Q5SSZ5 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tns3Q5SSZ5 Chac2-202ENSMUST00000101394 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tns3Q5SSZ5 Ndufaf1-203ENSMUST00000110802 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tns3Q5SSZ5 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tns3Q5SSZ5 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tns3Q5SSZ5 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tns3Q5SSZ5 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tns3Q5SSZ5 Gm5257-201ENSMUST00000121823 790 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Tns3Q5SSZ5 Gm37229-201ENSMUST00000191643 732 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tns3Q5SSZ5 Gm43610-201ENSMUST00000199117 365 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Tns3Q5SSZ5 Mpv17-206ENSMUST00000201353 846 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tns3Q5SSZ5 2010109P13Rik-201ENSMUST00000204605 392 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Tns3Q5SSZ5 Gm45079-201ENSMUST00000205627 461 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tns3Q5SSZ5 Gm18706-201ENSMUST00000210053 1066 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms