Protein–RNA interactions for Protein: Q5F4S9

Trpm3, Transient receptor potential cation channel, subfamily M, member 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,721 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpm3Q5F4S9 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trpm3Q5F4S9 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trpm3Q5F4S9 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trpm3Q5F4S9 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trpm3Q5F4S9 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trpm3Q5F4S9 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trpm3Q5F4S9 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trpm3Q5F4S9 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trpm3Q5F4S9 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trpm3Q5F4S9 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trpm3Q5F4S9 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trpm3Q5F4S9 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trpm3Q5F4S9 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trpm3Q5F4S9 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trpm3Q5F4S9 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trpm3Q5F4S9 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trpm3Q5F4S9 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trpm3Q5F4S9 H1foo-203ENSMUST00000161969 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trpm3Q5F4S9 Gm7535-201ENSMUST00000164167 909 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trpm3Q5F4S9 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Trpm3Q5F4S9 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trpm3Q5F4S9 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trpm3Q5F4S9 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Trpm3Q5F4S9 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trpm3Q5F4S9 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trpm3Q5F4S9 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trpm3Q5F4S9 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trpm3Q5F4S9 Lce1e-201ENSMUST00000090867 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trpm3Q5F4S9 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trpm3Q5F4S9 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trpm3Q5F4S9 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trpm3Q5F4S9 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trpm3Q5F4S9 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trpm3Q5F4S9 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trpm3Q5F4S9 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trpm3Q5F4S9 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trpm3Q5F4S9 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trpm3Q5F4S9 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trpm3Q5F4S9 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trpm3Q5F4S9 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trpm3Q5F4S9 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trpm3Q5F4S9 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trpm3Q5F4S9 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trpm3Q5F4S9 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trpm3Q5F4S9 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trpm3Q5F4S9 Adap2os-201ENSMUST00000140556 984 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trpm3Q5F4S9 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trpm3Q5F4S9 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trpm3Q5F4S9 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trpm3Q5F4S9 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trpm3Q5F4S9 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Trpm3Q5F4S9 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trpm3Q5F4S9 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trpm3Q5F4S9 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trpm3Q5F4S9 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trpm3Q5F4S9 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trpm3Q5F4S9 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trpm3Q5F4S9 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trpm3Q5F4S9 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trpm3Q5F4S9 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trpm3Q5F4S9 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trpm3Q5F4S9 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trpm3Q5F4S9 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trpm3Q5F4S9 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trpm3Q5F4S9 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trpm3Q5F4S9 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trpm3Q5F4S9 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trpm3Q5F4S9 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trpm3Q5F4S9 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trpm3Q5F4S9 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trpm3Q5F4S9 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trpm3Q5F4S9 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Trpm3Q5F4S9 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Trpm3Q5F4S9 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Trpm3Q5F4S9 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trpm3Q5F4S9 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Trpm3Q5F4S9 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trpm3Q5F4S9 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Trpm3Q5F4S9 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trpm3Q5F4S9 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trpm3Q5F4S9 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Trpm3Q5F4S9 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trpm3Q5F4S9 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trpm3Q5F4S9 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trpm3Q5F4S9 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trpm3Q5F4S9 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trpm3Q5F4S9 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trpm3Q5F4S9 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trpm3Q5F4S9 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trpm3Q5F4S9 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trpm3Q5F4S9 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trpm3Q5F4S9 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trpm3Q5F4S9 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trpm3Q5F4S9 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trpm3Q5F4S9 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Trpm3Q5F4S9 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trpm3Q5F4S9 Tulp2-202ENSMUST00000085331 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trpm3Q5F4S9 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trpm3Q5F4S9 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trpm3Q5F4S9 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms