Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZN08

Fam220a, Protein FAM220A, mousemouse

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Length 260 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam220aQ3ZN08 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fam220aQ3ZN08 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fam220aQ3ZN08 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fam220aQ3ZN08 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fam220aQ3ZN08 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fam220aQ3ZN08 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fam220aQ3ZN08 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fam220aQ3ZN08 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fam220aQ3ZN08 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fam220aQ3ZN08 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fam220aQ3ZN08 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fam220aQ3ZN08 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fam220aQ3ZN08 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fam220aQ3ZN08 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fam220aQ3ZN08 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fam220aQ3ZN08 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fam220aQ3ZN08 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fam220aQ3ZN08 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fam220aQ3ZN08 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fam220aQ3ZN08 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fam220aQ3ZN08 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fam220aQ3ZN08 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fam220aQ3ZN08 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fam220aQ3ZN08 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Fam220aQ3ZN08 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fam220aQ3ZN08 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
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Fam220aQ3ZN08 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fam220aQ3ZN08 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fam220aQ3ZN08 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fam220aQ3ZN08 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fam220aQ3ZN08 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
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Fam220aQ3ZN08 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 Plekhb1-205ENSMUST00000107046 2793 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
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Fam220aQ3ZN08 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Fam220aQ3ZN08 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Fam220aQ3ZN08 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Fam220aQ3ZN08 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Fam220aQ3ZN08 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Fam220aQ3ZN08 Prf1-202ENSMUST00000219375 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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